改进的Illumina图书馆准备工具包是澳大利亚基因组研究设施的理想解决方案
作品简介:
AGRF是一家非营利组织,致力于质量和创新。AGRF积极寻求合作伙伴并分享其在基因组学方面的知识和专业知识。AGRF通过其国家网络提供创新和领先技术的使用,使基因组学能够应用于生物医学、农业和环境部门。
Illumina公司推出2020年6月,三个新的RNA库准备试剂盒和2020年7月,一个新的无DNA pcr文库准备试剂盒.Noune博士和他的团队评估了这些新工具包,它们提供了更快、更低投入和更低成本的图书馆准备工作流程。
AGRF不断努力将前沿服务引入市场。注册我们即将到来的网络研讨会请听Noune博士讨论这些工作流提供的显著性能改进。
Christopher Noune博士是位于墨尔本的澳大利亚基因组研究机构(AGRF)的国家下一代测序经理。
问:你喜欢每个新套件的哪些功能?
一个。新的Illumina Illumina单链mRNA制备,连接在低输入和高输入下表现出高性能,在不同输入中具有高转录同源性。除此之外,该试剂盒还展示了高性能、低质量RNA和流线型工作流程,通过进一步的处理优化,该工作流程可压缩为一天。这表明与TruSeq相比有了巨大的改进™ 因为它将使用非优化方案将96个样本的处理时间缩短35%(10小时对6.5小时)。
同样的好处也可以说是为Illumina链总RNA预处理与Ribo Zero Plus连接,但此外,耗尽模块的通用性允许所有样品用同一试剂盒处理,而不需要为不同的耗尽类型储备。对于不同的物种,使用单一的耗竭而不是多个不同的耗竭可以节省时间。
为Illumina DNA无PCR制备该协议的简单性质意味着我们可以在1.5 - 2小时内生成一个库,这是一个跨越,因为TruSeq PCR-Free传统上需要1 - 1.5天的时间来处理,包括机械剪切和额外的QC检查。协议中描述的较低的输入工作流程允许我们向更广泛的研究人员提供无pcr。
总的来说,我们测试的所有工具包的Illumina协议都编写得很好,易于遵循,比以前的迭代快得多。
问:Illumina图书馆在AGRF的未来计划是什么?
一个。我们计划从现有的TruSeq系列迁移到新的Illumina Prep系列。这将给AGRF带来一些好处,如:;
- 流线型的服务
- 与TruSeq家族相比,成本更低,准备速度更快
- 大大降低了起始材料要求,这使得AGRF能够提供无PCR的全基因组测序标准服务。
“Illumina链Total和mRNA preps在低输入和高输入条件下都表现出了高性能。Illumina Ribo-Zero Plus rRNA耗尽模块被证明可以显著地消耗各种样品中的rRNA含量。耗尽模块的通用性使样品可以用相同的试剂盒处理,而不需要为不同的耗尽类型储备。总的来说,高性能、灵活性和精简的单日工作流程使这些试剂盒成为RNA制备的理想解决方案。”
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体验更快的图书馆准备:
sapac.illumina.com/technologies/sequencement/ngs-library-prep.html
简单、定制的RNA-Seq工作流:
sapac.illumina.com/techniques/sequencing/ngs-library-prep/rna.html