理解双指标排序
独特的双索引允许您增加每次运行测序的样本数量，并与其他索引策略相比降低每个样本成本。只需一个独特的双索引板，即可将96个样品汇集在一起。
双指标测序策略
除了唯一双索引外，双索引排序的另一种策略是使用组合双索引。在为多路复用准备库时，我们建议使用唯一的双索引。对于双索引库，排序运行包括两次额外的读取。额外的读取数据允许运行后分析软件以更高的准确性进行多路复用。
独特的双索引
为了防止孔板中重复序列，唯一双标度在样品两端使用唯一标识符。
一个独特的双索引板可以使用96个唯一的索引1 (i7)适配器和96个唯一的索引2 (i5)适配器将96个样本合并在一起。
组合双索引
使用组合对偶索引，序列在井板的行和列之间重复。
索引被限制为8个唯一的双对的索引组合，因此索引适配器共享一些序列。大多数库在i7或i5端共享序列。
独特双和组合双指标适配器的比较
一个独特的双标板可以将96个样品汇集在一起。而组合对偶索引则仅限于8个唯一对偶对的索引组合。
为关键应用程序推荐的索引适配器和库准备套件
| 应用程序 | 图书馆准备工具 | 索引建议解决方案 |
|---|---|---|
| 全基因组测序 | Illumina公司DNP预科 | IDT为Illumina UD指数 |
| RNA序列 | Illumina链mRNA准备 Illumina链总RNA Prep |
IDT为Illumina - RNA |
| 扩增子测序 | Amplumina Poinels | Illumina的AmpliSeq UD指标(≤24个样品) Illumina的扩增UD索引（适用于> 24个样本） |
| 有针对性的DNA富集 | Illumina DNA富集准备 | Idt for Illumina Nextera UD索引 |
经常一起购买
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我应该使用独特的双索引或独特的分子标识符吗？
唯一双索引在多路复用时可以有效地减少索引跳变引起的样本错配。当使用带有图形流池的仪器时，例如NovaSeq 6000系统，udi尤其有效。
独特的分子识别器已经被证明可以降低变异呼叫的假阳性率和增加变异检测的敏感性。它们用于去除DNA和cDNA中的PCR重复，以及检测低频变异，如高复用CNV检测。yobet亚洲亚博官网人口了解更多关于独特的分子标识符。
单索引vs双索引
一般来说，双索引是首选的路由。双索引测序确实需要额外的周期;然而，试剂套件提供了足够的执行额外的周期。在以下情况下，您可能仍然希望执行单索引:
- 仪器不支持双测序(HiSeq 1000/1500系统)
- 读取需要更长的基础
- 您的日程计划不允许运行第二个索引所需的额外1-2小时
双索引排序资源
Illumina公司适配器序列
本文献包含用于几种Illumina文库预备套件的Illumina适配器的寡核苷酸序列。
索引顺序指导
yobet亚洲了解Illumina仪器上的单索引和双索引测序。
Illumina适配器池指南
本文档提供了在使用索引库时在所有Illumina系统中优化颜色平衡的建议。
Illumina公司适配器支持
查找用于Illumina唯一双索引的IDT的有用资源和支持信息。