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RNA外显子组捕获测序

RNA外显子组捕获测序简介

在不牺牲基因融合发现能力的情况下,实现低成本、准确、敏感的RNA外显子分析,即使是困难的样品。许多RNA外显子组测序方法侧重于确定数量的已知转录本,或者需要昂贵的深度测序。RNA外显子捕获测序通过结合RNA- seq和外显子富集来克服这些挑战。

该方法仅捕获转录组的编码区,与非外显子组捕获方法相比,具有更高的吞吐量和更低的测序深度。RNA外显子组的序列特异性捕获不依赖于poly-a尾的存在。这使得RNA外显子捕获测序成为低质量样本或起始材料有限的RNA Seq的理想选择。

RNA外显子组捕获测序的优点

分离转录组编码区域可在总RNA测序的阅读深度的一小部分实现发现能力的最大化。

  • 高样品吞吐量和成本效率
  • 专注于高价值的内容
  • 从降解样品中获得高质量的数据,包括福尔马林固定、石蜡包埋(FFPE)组织
  • 在保持高灵敏度的同时,需要低样本输入(总RNA量仅为10纳克)
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Illumina杰出科学家Gary Schroth博士展示了RNA-Seq技术的最新进展。yobet亚洲了解最新的RNA库准备方法如何允许从挑战样本转录组分析,如单细胞或FFPE组织。

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RNA外显子组捕获测序流程

Illumina sequencing by synthesis (SBS) chemistry是应用最广泛的NGS技术,生成了全球90%以上的测序数据

除了行业领先的数据质量,Illumina还提供整合的RNA外显子组捕获工作流,简化了从文库准备到数据分析和生物学解释的整个过程。

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*数据计算存档。yobet亚洲Illumina公司有限公司,2015年版