什么是配对末端测序？
配对端测序允许用户对片段的两端进行测序，并生成高质量的、可对齐的序列数据。对端测序有助于检测基因组重排和重复序列元件，以及基因融合和新的转录本。
除了在库准备过程中产生两倍数量的读之外，以读对对齐的序列还能够更准确地进行读对齐，并能够检测插入-删除(indel)变体，这在单读数据中是不可能的。1.所有Illumina下一代测序（NGS）系统都能够进行配对末端测序。
成对末端测序突出显示
- 简单配对端库：简单的工作流程允许生成唯一的插入尺寸范围
- 有效使用样本：需要与单读基因组DNA或cDNA测序相同数量的DNA
- 广泛的应用：不需要DNA甲基化或限制性消化；可用于亚硫酸氢盐测序
- 简单的数据分析:启用具有短插入库的高质量序列程序集。对标准单读库准备过程的简单修改有助于在一次配对末端读取期间读取每个簇的正向和反向模板链。两个读取都包含远程位置信息，允许读取的高度精确对齐。
Paired-End DNA测序
配对结束DNA测序读取读取含有重复序列的DNA区域的高质量对准，并产生长折叠德诺维通过填补共识序列中的空白进行排序。对端DNA测序还可以检测常见的DNA重排，如插入、缺失和倒置。
Paired-End RNA序列
配对结束RNA测序（RNA-SEQ）使得发现应用，例如检测癌症中的基因融合，并表征新型剪接同种型。2.
对于配对结束RNA-SEQ，使用以下套件具有交替碎片协议，然后使用标准的Illumina成对终端簇生成和测序。
对于mRNA序列库准备，使用：
对于链总RNA库的准备，使用:
单读排序
单读测序只对DNA的一端进行测序，是利用Illumina测序最简单的方法。该解决方案能够快速、经济地提供大量高质量数据。单读测序对于某些方法，如小rna测序或染色质免疫沉淀测序(ChIP-Seq)，是一个很好的选择。
有兴趣接收Illumina基于你感兴趣的领域的时事通讯、案例研究和信息吗?现在报名。
额外的资源
测序技术视频
请参阅正在运行的SBS技术。
测序平台选择工具
比较Illumina测序系统的速度和吞吐量，为您的实验室找到最佳仪器。
参考文献
- 基于实验设计的序列读取档案中高通量测序数据的功能挖掘和表征。《公共科学图书馆•综合》。2013;8 (10):e77910。
- RNA-Seq:转录组学的革命性工具。纳特·杰内牧师。2009; 10:57 - 63。