了解基因表达在不同细胞和组织中的表观遗传调控是系统生物学的一个关键问题。自2013年首次报道以来,转座酶可达性染色质测序(ATAC-seq)已被广泛采用,作为一种敏感、稳健的全基因组染色质可达性分析工具。此后,ATAC-seq被用于单细胞分析,以研究异质性细胞群的不同组织中细胞类型特异性染色质可及性。
这个网络直播将向参与者展示如何使用ATAC-seq,以及它如何与其他染色质可达性分析方法相适应。首先,William Greenleaf将讨论ATAC-seq的发展,它的使用,以及对单细胞的适应。Bing Ren和Sebastian Preissl随后将讨论使用组合索引的单细胞ATAC-seq,以及在大脑、心脏和其他组织中的应用。这些报告之后将与演讲者进行现场讨论。
威廉‧格林利夫
副教授
斯坦福大学
Bing任
细胞和分子医学教授
加州大学圣地亚哥分校
塞巴斯蒂安Preissl
单细胞基因组学副主任
UCSD表观基因组学研究中心