Corona病毒软件
IllumaSARS-Cov-2NGS数据工具包
| 新病原体检测 |  |
DRAGEN元学应用 | ||
|---|---|---|---|---|
| 检测监视 |  |
DRAGENRNA病原体检测应用 |  |
DRAGENCOVID线程应用 |
| 分享协作 |  |
SRA导入App |  |
GISAID提交程序 |
| IllumaSARS-COV-2NGS数据工具包可在基础空间序列枢纽上获取 | ||||
关于IllumaSARS-COV-2NGS数据工具包
Corona病毒软件分析解决方案套件检测并监控SARS-COV-2免费基础空间序列枢纽.工具箱由数个工具组成光照DRAGEN二次分析数据提交程序基础序列枢纽授权研究人员无缝向公共数据库提交结果
DRAGEN Corona病毒软件工具
IllumaSAS-COV-2NGS数据工具箱利用DRAGEN速度和精度加速传染病监控和突发响应工具箱中包括DRAGEN元子流体识别新传染病病原体,DRAGENRNA病原体管道检测病毒病原体,DRAGEN线性应用检测SARS-COV-2环境变异DRAGEN日志病毒工具可用基础空间序列枢纽访问有关用DRAGEN平台检测和监控corona病毒的额外信息可见软件博客贴文.
DRAGENRNA病原体检测管道
更新版DRAGENRNA管道现可用以加速检测病毒病原体管线帮助检测所有DRAGENRNA-Seq管道中的SARS-COV-2管道包括:
- 综合检测,利用覆盖法和kmer法检测病毒病原体
- 兼容性Illuma呼吸道病毒目标浓缩工作流
- 使用人类基因组参考集(hg38)和选择病毒参考序列
- FASTA综合生成上传公共数据库,如GISAID
DRAGENCOVID线程应用
应用对齐读取SARS-COV-2参考基因组和报告目标区域覆盖运行方式 :
- K-mer基础检测
- 地图对称变换调用
- 共识序列代
- 线性/轨迹分析使用Pangolin和NextClade
Corona病毒软件临床应用
用户想生成SARS-COV-2检测诊断表征病人COVID-19时,DRAGENCOVIDSeq测试流水线协同使用Illumacovideq测试
用户想生成散弹相位学报告时,IDbyDNA开发Explify平台提供简单强生物信息软件,将Iluma测序器生成的数据转换为可操作洞察力验证自动化平台支持检测35种呼吸道病毒,包括SARS-COV-2基因组特征yobetesportsyobet亚洲学习更多
相关主机响应研究引擎
Illuma为COVID-19研究界提供协作环境,以更好地了解调控宿主响应和帮助识别潜在处理生物标志的关键因素
关联引擎如何推进您的研究
- 插入上下文:关联引擎挖掘数千项基因组研究,使研究人员能将其数据与世界基因组知识库相整合,生成数据驱动解答
- 加速研究利用关联引擎即时查询数千项研究并通过实时数据驱动查询帮助验证假设
- 保持当前状态 :Illuma拥有一支致力于更新COVID-19数据关联引擎的专门团队,并欢迎研究界成员提供研究成果帮助推进COVID-19研究
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- 协作性 :关联引擎允许研究人员向研究界提供并分享数据,以增进我们对COVID-19主机响应的理解
科学家可用清晰LIMS处理样本测序完成后,研究人员可使用工具箱自动向BaseSpace序列枢纽流数据
端对端解决方案
SARS-COV-2检测
Illuma使用综合综合工作流系统检测识别SARS-COV-2比较简单
corona病毒软件工具箱兼容Illuma病毒目标浓缩工作流,授权研究人员安全流数据直接从全组序列器流入BaseSpace序列枢纽使用DRAGENRNA病原体检测应用快速综合分析分析完成后,研究人员可直接从BaseSpace序列枢纽向分享所有流感数据全球倡议提交数据
科学家想提高实验室效率时,清晰LIMS可用于跟踪并监控COVID-19样本,提供端对端综合解决方案
清晰性LIMS吸附病毒板工作流
综合工作流管理样本跟踪
清晰LIMS提供高效样本跟踪和工作流程自动化可用日志病毒工作流
- CCDCCOVID-19RT-PCR工作流
- 呼吸式病毒分组工作流
工作流可帮助确保样本可行分析,允许实验室快速处理corona病毒样本,从样本加入和库准备到执行QC排序运行
yobet亚洲更多了解清晰LIMS
易安全分享、协作和提交公共数据库
基础空间序列枢纽设计方便研究组间安全审计控制协作数据管理分享能力,如工作分组,允许你分享项目并安全运行与协作者而无需文件下载
IllumaSARS-COV-2NGS数据工具包特征基础空间序列枢纽应用请求协作上头GISAID提交程序VCF或FASTA文件集合和同样样本元CSVapp验证数据后再向GISAID提交数据供进一步QA处理
下载基础空间安全信息如何存取IllumaSARS-COV-2NGS数据工具包
光照SARS-COV-2NGS全数据工具包可见基础空间序列枢纽DRAGENCOVID-19更新工具也可从DRAGEN服务器上获取并正通过DRAGENAPI向开发者提供请求访问DRAGENAPI
IllumaSARS-COV-2NGS数据库工具箱
研究人员今天可免费使用基础空间序列枢纽数据工具箱IllumaSARS-COV-2NGS研究人员可直接从工具流入BaseSpace安全云环境,供推键使用整个工具箱
yobet亚洲更多了解基础空间序列枢纽特征产品
基础空间序列枢纽和iCridits
基础空间序列枢纽便于管理分析数据iCridets使用货币购买Illuma基因组数据存储和分析选项
DRAGEN生物IT平台
IllumaDRAGEN生物IT平台提供精确超快速二级分析排序数据
extSeq2000系统试剂
NextSeq2000系统支持新出现和中排量排序应用以及广度方法,如直方排序、目标浓缩、单细胞剖析图学、转录法排序等
请求访问DRAGENAPI
附加Corona病毒软件工具
目标浓缩管道
DRAGEN浓缩管道也可以调用检测和识别SARS-COV-2管道可上网基础序列枢纽获取低样本成本,并可通过DRAGEN服务器访问
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