Nextera DNA Flex图书馆准备装备
快速集成工作流对于广泛的应用程序,从人类全基因组测序扩增子,质粒和微生物物种。阅读更多…
图书馆准备
指数适配器
总:
Nextera DNA Flex图书馆准备工具包提供了许多全基因组测序应用程序的灵活性。
Nextera DNA Flex图书馆准备工具使用一个快速,友好的工作流程。On-bead tagmentation化学降低总图书馆准备时间~ 3.5小时,从DNA提取库规范化。
Nextera DNA Flex工作流支持广泛的DNA输入范围(1 - 500 ng),多个样本类型,和这两个小型和大型基因组。工作流程包括从血液中提取DNA,唾液,或干血滴*细菌菌落*。
获得灵活性序列人类或其他大型,复杂基因组扩增子或微生物物种,所有与一个工具包。
适应不同学习需求时,Nextera DNA Flex工作流提供了插入大小一致,均匀覆盖,和优化性能,不管输入量或基因组DNA的大小。bead-based技术减少偏见和错误的机会,导致高度可再生的测序数据。
的踊跃参与®对于Illumina公司®-Nextera™DNA UD索引集A, B, C, D索引提供多达384独特的双索引,使准确的作业流读取和使用效率的细胞。这些独特的双指数代码使用10个碱基对代码。这种变化在碱基对指数代码需要调整顺序运行设置。
Nextera DNA CD索引支持多达96 -样本组合双重索引。24 CD索引以管提供格式,和96年一盘格式。
全基因组测序、DNA Nextera Flex图书馆准备工具包是推荐的替代Nextera DNA库准备装备,已停止。如果你是使用Nextera DNA(猫。不。fc - 121 - 1030 (Cat)或独立的组件。15027865和15027865号)ATAC-Seq * *或其他自定义应用程序,Illumina公司Tagment TDE1 DNA酶和缓冲设备是我们建议的替代方案。
*显示可用的协议。
* *在应用程序
发现权力Nextera技术可以通过这个互动体验带给您的实验室。Nextera图书馆准备装备解决方案提供全基因组测序在各种应用程序中,灵活性在Illumina公司测序和集成示例输入没有量化的血液和唾液。
查看信息
| 仪器 | 推荐的样品数量 | 读取长度 |
|---|---|---|
| NextSeq 550系统 | 1样品/运行(高输出;基于30×人类基因组的报道) | 2×150个基点 |
| HiSeq 2500系统 | 每运行样本2 - 10(双流细胞;基于30×人类基因组的报道) | 2×125个基点(快速运行) 2×150个基点(高输出) |
| Nextera DNA Flex图书馆准备装备 | TruSeq DNA PCR-Free | TruSeq DNA纳米 | |
|---|---|---|---|
| 试验时间 | ~ 3 - 4个小时(从DNA提取标准化库) | 5个小时总试验时间 | ~ 6小时总试验时间 |
| 自动化功能 | 液体处理机器人 | 液体处理机器人 | 液体处理机器人 |
| 描述 | 一种快速、灵活的工作流为范围广泛的研究应用和样本类型,从人类微生物全基因组测序和更多。 | 一个简单的全套PCR-free准备全基因组测序研究的能力通过挑战性的区域的基因组序列。 | 一个低投入的研究方法是提供高质量的基因组覆盖率,减少偏见。 |
| 实践时间 | 1 - 1.5小时 | 4个小时 | ~ 4个小时 |
| 输入数量 | 小基因组(如微生物):1 - 500 ng DNA。大型基因组(如人类):100 - 500 ng DNA。(血液和唾液,见参考指南)。 | 1 ug DNA | 100 ng基因组DNA |
| 的作用机制 | Bead-linked transposome | 机械DNA碎片和适配器结扎。工作流是PCR-free gel-free。 | 机械DNA碎片和适配器结扎。工作流使用reduced-bias PCR和gel-free。 |
| 方法 | 扩增子测序,从头测序,鸟枪测序,全基因组测序 | 基因分型结果进行排序,鸟枪测序,全基因组测序 | 基因分型结果进行排序,鸟枪测序,全基因组测序 |
| 多路复用 | 384独特的双(UD)组合和96组合双(CD)的组合 | 24位单身96组合(CD)双24独特的双和96独特的双(UD)组合(很快) | 24位单身96组合(CD)双24独特的双和96独特的双(UD)组合(很快) |
| 专门的样本类型 | 血,不是FFPE-Compatible,唾液 | 不是FFPE-Compatible | 低投入的样品,而不是FFPE-Compatible |
| 物种分类 | 任何物种,细菌、果蝇、人力,哺乳动物,老鼠,线虫,植物,老鼠,病毒,酵母,斑马鱼 | 人类,哺乳动物,老鼠,其他工厂,老鼠 | 人类,哺乳动物,老鼠,其他工厂,老鼠 |
| 物种的细节 | 兼容任何物种 | 兼容大部分DNA基因组。 | 兼容大部分DNA基因组。 |
| 插入目标大小 | ~ 500个基点 | 350个基点和550个基点 | 350个基点和550个基点 |
(一)Bead-linked transposomes调解同时分裂gDNA以及Illumina公司测序引物。(B)减少了PCR扩增放大测序DNA片段和添加索引和适配器。(C) Sequencing-ready碎片洗和汇集。
高分辨率微生物使用Whole-Metagenome测序和CosmosID基于云的生物信息学分析
应用注释| PDF3 MB
一个自动Nextera DNA Flex库高通量宏基因组工作流准备
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人类全基因组测序Nextera DNA Flex图书馆准备装备
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应用注释| PDF1 MB
微生物全基因组测序的Nextera DNA Flex图书馆准备装备
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快速、灵活、Self-Normalizing图书馆准备与Nextera Flex化学
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Nextera DNA Flex图书馆猎枪准备土壤宏基因组分析
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