COVIDSeq测试(RUO版)

Illumina COVIDSeq Test (RUO版本)是一种基于扩增子的NGS检测方法，包括2019-nCoV引物，旨在检测SARS-CoV-2病毒的突变和描述RNA，以帮助临床研究实验室识别和跟踪新型SARS-CoV-2毒株的出现和流行。

快速、可扩展的SARS-CoV-2检测

Illumina COVIDSeq测试(RUO版本)可以放大或缩小，以适应不同数量的样本。在NovaSeq 6000系统上使用两个SP或S4试剂包可以在12小时内处理1536至3072个结果，或者使用NextSeq 2000 P2 v3试剂包或NextSeq 500/550/550Dx(在研究模式下)HO试剂包在12小时内处理384个结果。

工作流程和组件

工作流程包括病毒RNA提取，RNA至cDNA转化，PCR，文库制备，测序，分析和报告生成步骤。关键组件包括高通量Novaseq 6000系统或NextSeq 2000系统或NextSeq 500/550 / 550DX（在研究模式）系统，加上Illumina Covidseq测试（Ruo版）和Dragen Covidseq测试应用程序（Ruo版）在Basespace序列集线器中进行快速分析。

设计及品质控制

Illumina Covidseq测试（Ruo版）利用了经过验证的公开的Artic Multiplex PCR协议的改进版本，其中98个扩增子设计用于扩增SARS-COV-2病毒特异性序列，结合经过验证的Illumina测序技术。当检测到+90个扩增子时，Covidseq提供共识序列信息。PCR步骤中的63°C退火温度改善了变体分析 - 为样品中存在的SARS-COV-2菌株提供重要的洞察力，并能够跟踪病毒菌株。

可以将共识序列信息（FASTA文件）上载到打开的软件工具中以分配谱系和注释突变。FASTA文件可以通过BaseSace测序集线器轻松上传到NCBI和/或GISAID应用程序，以增加方便。