Illumina covid - seq检测用于授权国家的SARS-CoV-2病毒RNA检测*和用于研究的病毒基因组分析。了解样本中存在的SARS-CoV-2毒株有助于跟踪病毒毒株。这种基于扩增子的NGS检测包括2019-nCoV引物,用于检测疑似COVID-19感染症状和体征的患者鼻咽、口咽和中鼻甲鼻拭子中SARS-CoV-2病毒的RNA。
Illumina COVIDSeq测试可以放大或缩小,以适应不同数量的样本。在NovaSeq 6000系统上,使用两个SP或S4试剂包可以在12小时内处理1536至3072个结果,使用NextSeq 2000或NextSeq 500/550/550Dx(在RUO模式下)HO试剂包可以在12小时内处理384个结果。
该工作流程包括病毒RNA提取、RNA到cdna转换、PCR、文库制备、测序、分析和报告生成等步骤。关键组件包括高吞吐量的NovaSeq 6000系统或NextSeq 2000系统或NextSeq 500/550/550Dx(在RUO模式下)系统,以及Illumina COVIDSeq测试和DRAGEN COVIDSeq测试管道或DRAGEN COVIDSeq测试应用程序在BaseSpace序列集线器快速分析。
Illumina-COVIDSeq试验利用经验证的、公开可用的ARTIC多重PCR协议的改进版本,98个扩增子设计用于扩增SARS-CoV-2病毒特异性序列,并结合经验证的Illumina测序技术。作为一项质量特征,每个样本中都包含由11个人类mRNA靶点组成的内部控制。当检测到+90个扩增子时,测试报告了一致的序列,这使得病毒基因组分析能够帮助跟踪研究环境中的病毒株。
Illumina COVIDSeq测试是下一代测序(NGS)在体外Illumina NovaSeq 6000测序系统、NextSeq 2000测序系统、NextSeq 500测序系统、NextSeq 550测序系统或NextSeq 550Dx仪器的诊断试验,用于定性检测鼻咽(NP)拭子、口咽(OP)拭子、前鼻拭子、中鼻甲鼻拭子中的SARS-CoV-2 RNA,来自医疗服务提供者怀疑感染新冠病毒-19的个人的鼻咽冲洗液/吸液、鼻吸液和支气管肺泡灌洗液(BAL)样本。
检测仅限于根据1988年临床实验室改进修正案(CLIA), 42 U.S.C.§263a认证的实验室,用于执行高复杂性的检测。
结果用于SARS-CoV-2 RNA的鉴定。SARS-CoV-2 RNA通常可在感染急性期的呼吸道标本中检测到。阳性结果表明存在SARS-CoV-2 RNA;确定患者感染状况需要与患者病史和其他诊断信息的临床相关性。阳性结果不排除细菌感染或与其他病毒合并感染。美国及其领土内的实验室必须向有关卫生当局报告所有阳性结果。阴性结果不能排除SARS-CoV-2感染,不应作为患者管理决策的唯一依据。
阴性结果必须结合临床观察、病史和流行病学信息。Illumina COVIDSeq测试适用于经过资质和培训的临床实验室人员,特别是经过NovaSeq 6000测序系统、NextSeq 2000测序系统、NextSeq 500测序系统、NextSeq 550测序系统或NextSeq 550Dx仪器的使用培训的人员。以及下一代测序工作流程在体外诊断程序。Illumina covid - seq测试仅在食品和药物管理局的紧急使用授权下使用。
请联系Illumina代表了解区域可用性。
*授权机构:加拿大卫生部、日本药品和医疗器械署(PMDA)、菲律宾食品和药物管理局、新加坡健康科学局(HSA)、南非健康产品管理局(SAHPRA)和美国食品和药物管理局。