TruSeq DNA纳米
生成全基因组测序库和有效的讯问有限的可用的DNA样本。阅读更多…
图书馆准备
指数适配器
Illumina公司优势产品
总:
提供更大的灵活性在订购单一组件库的准备,我们搬到一个模块化的配置。我们现有TruSeq Nano DNA库准备包(猫。不。fc - 121 - 4001, fc - 121 - 4002, fc - 121 - 4003)将过渡到TruSeq DNA纳米(猫。20015964 24号样品和猫。96年20015965号样品)图书馆准备。指数适配器将分别作为TruSeq DNA单一索引(猫。20015960号设置和猫。20015961号B)和TruSeq DNA CD(组合双)索引(猫。不,20015949)。
TruSeq DNA纳米支持有效的审讯有限的可用的DNA样本。基于机械fragmentation-ligation化学、低投入的方法提供高覆盖率为几乎任何排序应用程序质量和减少偏见。
TruSeq精简了DNA纳米凝胶大小选择替换为bead-based选择,使研究人员准备高质量的图书馆在不到一天。优化各种阅读的长度,从2×101 bp 2×151个基点。
TruSeq DNA纳米提供优秀的结果与100 ng输入,消除典型要求微克的DNA。这使研究人员可以研究有限的可用的DNA样本(如肿瘤样本),帮助保持样本用于未来的或替代的研究。除了加速工作流,bead-based大小选择避免与凝胶相关联的典型样品损失选择。
TruSeq DNA纳米减少的数量和平均尺寸PCR-induced覆盖面的典型特征。增强的工作流程减少图书馆偏差和提高整个基因组覆盖均匀。这些工具还提供了优秀的传统上具有挑战性的基因组的报道内容,包括GC-rich地区、推动者和重复区域。这使研究人员能够访问更多的信息从每个序列运行。Truseq为高质量的基因组DNA纳米产品验证覆盖任何新一代测序的应用程序。
| 仪器 | 推荐的样品数量 | 读取长度 |
|---|---|---|
| NextSeq 550系统 | 1样品/运行(基于30×人类基因组的报道) | 350个基点插入:≤2×100个基点 550个基点插入:≤2×150个基点 |
| HiSeq 2500系统 | 每运行样本2 - 10(双流细胞;基于30×人类基因组的报道) | 快速运行,350个基点插入:≤2×100个基点 快速运行,550个基点插入:≤2×250个基点 高输出,350个基点插入:≤2×100个基点 高输出,550个基点插入:≤2×125个基点 |
| TruSeq DNA纳米 | TruSeq DNA PCR-Free | Nextera DNA Flex图书馆准备装备 | |
|---|---|---|---|
| 试验时间 | ~ 6小时总试验时间 | 5个小时总试验时间 | ~ 3 - 4个小时(从DNA提取标准化库) |
| 自动化功能 | 液体处理机器人 | 液体处理机器人 | 液体处理机器人 |
| 描述 | 一个低投入的研究方法是提供高质量的基因组覆盖率,减少偏见。 | 一个简单的全套PCR-free准备全基因组测序研究的能力通过挑战性的区域的基因组序列。 | 一种快速、灵活的工作流为范围广泛的研究应用和样本类型,从人类微生物全基因组测序和更多。 |
| 实践时间 | ~ 4个小时 | 4个小时 | 1 - 1.5小时 |
| 输入数量 | 100 ng基因组DNA | 1 ug DNA | 小基因组(如微生物):1 - 500 ng DNA。大型基因组(如人类):100 - 500 ng DNA。(血液和唾液,见参考指南)。 |
| 的作用机制 | 机械DNA碎片和适配器结扎。工作流使用reduced-bias PCR和gel-free。 | 机械DNA碎片和适配器结扎。工作流是PCR-free gel-free。 | Bead-linked transposome |
| 方法 | 基因分型结果进行排序,鸟枪测序,全基因组测序 | 基因分型结果进行排序,鸟枪测序,全基因组测序 | 扩增子测序,从头测序,鸟枪测序,全基因组测序 |
| 多路复用 | 24位单身96组合(CD)双24独特的双和96独特的双(UD)组合(很快) | 24位单身96组合(CD)双24独特的双和96独特的双(UD)组合(很快) | 384独特的双(UD)组合和96组合双(CD)的组合 |
| 专门的样本类型 | 低投入的样品,而不是FFPE-Compatible | 不是FFPE-Compatible | 血,不是FFPE-Compatible,唾液 |
| 物种分类 | 人类,哺乳动物,老鼠,其他工厂,老鼠 | 人类,哺乳动物,老鼠,其他工厂,老鼠 | 任何物种,细菌、果蝇、人力,哺乳动物,老鼠,线虫,植物,老鼠,病毒,酵母,斑马鱼 |
| 物种的细节 | 兼容大部分DNA基因组。 | 兼容大部分DNA基因组。 | 兼容任何物种 |
| 插入目标大小 | 350个基点和550个基点 | 350个基点和550个基点 | ~ 500个基点 |
| 规范 | TruSeq DNA纳米 | TruSeq DNA PCR-Free |
|---|---|---|
| 设备类型 | TruSeq DNA纳米LT和HT | TruSeq DNA PCR-Free LT和HT |
| 描述 | 基于广泛采用TruSeq图书馆准备,较低的输入和提高数据质量 | 优越的基因组覆盖率从根本上减少图书馆偏见和差异 |
| 工作流 | LT工具包:人工工作流 HT工具包:Automation-friendly;手动协议也可 |
LT工具包:人工工作流 HT工具包:Automation-friendly;手动协议也可 |
| 输入数量 | 100 - 200 ng |
1 - 2μg |
| 包括聚合酶链反应 | 是的 | 没有 |
| 试验时间 | 5.5小时 | ~ 5小时 |
| 实践时间 | 4个小时 | ~ 4个小时 |
| 插入目标大小 | 350个基点和550个基点 | 350个基点和550个基点 |
| Gel-free | 是的 | 是的 |
| 支持的样本数量 | 24 (LT)或96 (HT)样本 | 24 (LT)或96 (HT)样本 |
| 尺寸选择珠子 | 包括 | 包括 |
| 应用程序 | 全基因组测序的应用程序,包括全基因组重测序,新创大会,和宏基因组研究 | |
| 样品多路复用 | 24位单身96组合(CD)双24独特的双和96独特的双(UD)的组合 | |
| 兼容的Illumina公司测序 | MiniSeq、MiSeq NextSeq、HiSeq NovaSeq, HiSeq X, HiScanSQ和基因组分析系统 | |
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Technical Note | PDF4 MB
数据表| PDF11 MB
