在RNA测序(RNA- seq)之前耗尽核糖体RNA (rRNA)使研究人员能够专注于分析转录组的高价值部分。Illumina rRNA去除溶液为RNA-Seq库的制备设定了rRNA和珠蛋白mRNA的去除标准。
rRNA耗尽过程:
| RNA样本 | 停止包 | 建议更换 | 删除Euk。细胞质核糖体rna | 去除线粒体核糖核酸 | 去除细菌核糖体rna | 删除叶绿体核糖体rna | 删除球蛋白mRNA |
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| 人类和其他动物物种和FFPE RNA | rRNA去除试剂盒(人/小鼠/大鼠) | TruSeq链总RNA文库人/小鼠/大鼠 | ✓ | ||||
| 人类和其他动物物种;FFPE RNA | 核糖零金rRNA去除试剂盒(人/小鼠/大鼠) | TruSeq链总RNA金 | ✓ | ✓ | |||
| 人类微生物组和其他细菌感染的人类、小鼠、大鼠样本 | 核糖零金rRNA去除试剂盒(流行病学) | 可选择的解决方案待定 | ✓ | ✓ | ✓ | ||
| 细菌 (革兰氏阴性菌和革兰氏阳性菌的混合种群) |
核糖零核糖核酸清除试剂盒（细菌） | 新产品待定，请联系技术支持 | ✓ | ||||
| 革兰氏阴性细菌 | rRNA去除试剂盒(革兰氏阴性菌) | 新产品待定，请联系技术支持 | ✓ | ||||
| 革兰氏阳性菌 | 核糖零核糖核酸清除试剂盒（革兰氏阳性菌） | 新产品待定，请联系技术支持 | ✓ | ||||
| 植物叶组织 | rRNA去除试剂盒(植物叶片) | 新产品待定，请联系技术支持 | ✓ | ✓ | ✓ | ||
| 植物种子或根组织 | rRNA去除试剂盒(植物种子/根) | TruSeq链总RNA库预备工厂 | ✓ | ✓ | ✓ | ||
| 哺乳动物血液RNA | Globin-Zero黄金装备 | 含零核球蛋白的TruSeq链总RNA | ✓ | ✓ | ✓ | ||
| 酵母 | 零核糖核酸去除试剂盒(酵母) | 没有替代方案 | ✓ | ✓ |
| 样本类型 | 停止包 | 建议更换 | 输入RNA (ScriptSeq) | 评论(ScriptSeq) |
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| Poly(A)选择或rrna耗尽的RNA(用户提供)，从任何来源，包括FFPE组织 | ScriptSeq v2 RNA-Seq文库制备试剂盒 | TruSeq滞留mRNA | 500pg - 50ng poly(A)-selected or rrna - depletion RNA(用户提供) | 不包括一个核糖零rRNA或一个球蛋白零球蛋白mRNA去除试剂盒。要求FailSafe PCR酶Mix(用户提供)。 |
| 人/鼠/鼠及其他高等脊椎动物;FFPE RNA | ScriptSeq Complete Gold Kit (Human/Mouse/Rat) | TruSeq链总RNA | 总RNA 1 - 5µg | 包括一个Ribo-Zero rRNA去除试剂盒和ScriptSeq库准备试剂盒。要求FailSafe PCR酶Mix(用户提供)。 |
| 血 | ScriptSeq Complete Gold Kit (Blood) | TruSeq链总RNA珠蛋白 | 总RNA 1 - 5µg | 包括球蛋白零rRNA/球蛋白mRNA去除试剂盒和ScriptSeq库准备试剂盒。要求FailSafe PCR酶Mix(用户提供)。 |
| 微生物组，感染人类/小鼠/大鼠的细菌 | ScriptSeq Complete Gold Kit(流行病学) | 其他供应商提供的替代品 | 500ng - 2.5µg总RNA | 包括一个Ribo-Zero rRNA去除试剂盒和ScriptSeq库准备试剂盒。要求FailSafe PCR酶Mix(用户提供)。 |
| 细菌 | ScriptSeq成套试剂盒（细菌） | 其他供应商提供的替代品 | 总RNA 1 - 5µg | 包括一个Ribo-Zero rRNA去除试剂盒和ScriptSeq库准备试剂盒。要求FailSafe PCR酶Mix(用户提供)。 |
| 植物叶 | ScriptSeq成套工具（植物叶片） | TruSeq链总RNA植物 | 总RNA 1 - 5µg | 包括一个Ribo-Zero rRNA去除试剂盒和ScriptSeq库准备试剂盒。要求FailSafe PCR酶Mix(用户提供)。 |
| 植物种子或根 | ScriptSeq Complete Kit(植物种子/根) | TruSeq链总RNA植物 | 总RNA 1 - 5µg | 包括一个Ribo-Zero rRNA去除试剂盒和ScriptSeq库准备试剂盒。要求FailSafe PCR酶Mix(用户提供)。 |
| 酵母 | ScriptSeq Complete Gold Kit(酵母) | 其他供应商提供的替代品 | 总RNA 100ng - 5µg | 包括一个Ribo-Zero rRNA去除试剂盒和ScriptSeq库准备试剂盒。要求FailSafe PCR酶Mix(用户提供)。 |