甚至从SAMPARESQ化学和Illumina的下一代测序(NGS)技术实现无与伦比的数据质量,即使是低质量的起始材料,如福尔马林固定的石蜡嵌入式(FFPE)组织。
Illumina定制DNA面板AmpliSeq | AmpliSeq for Illumina On-Demand | Nextera Flex for Encroce | Nextera快速捕获自定义富集试剂盒 | |
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内容规范 | 兴趣的定制内容 - 高达5 MB | 自定义内容从1(24个扩增子)到500(15000个扩增子)基因 | 外显子组:45mb外显子含量(≥98%的RefSeq、CCDS和Ensembl编码含量)。 习惯:0.5-15 MB的基因组含量。 固定面板:内容变化的面板。 |
自定义感兴趣的基因组内容(0.5 - 15 Mb) |
描述 | 定制研究测定,可用于重点对特定基因,地区或感兴趣的变体的研究重点。 | 从> 5000预测试基因的定制研究测定可用于将研究对感兴趣的特定基因,地区或感兴趣的变体集中起来。 | 快速、灵活的研究解决方案,实现全外显子组、定制和固定面板靶向测序。 | 定制研究工作流程,使用自定义面板,现有的Illumina设计的面板或先前订购的自定义项目,以实现有针对性的基因组内容的富集。 |
输入数量 | 1-100 ng(建议每个池10 ng) | 1 - 100 ng DNA | 10-1000 Ng高质量的基因组DNA或50-1000个NG FFPE DNA。(用于血液和唾液,请参阅参考指南)。 | 50 ng DNA |
的作用机制 | 多重聚合酶链反应 | 多重聚合酶链反应 | 珠结合转座体和杂交捕获化学 | 酶促碎裂和杂交的富集 |
方法 | 扩增子测序、自定义排序,通过测序进行基因分型那有针对性的DNA测序 | 扩增子测序那有针对性的DNA测序 | 自定义排序,外显子组测序那目标浓缩,靶心富集,有针对性的DNA测序 | 自定义排序,目标浓缩,靶心富集,有针对性的DNA测序 |
多路复用 | 96 -丛 | 96 -丛 | 多达384个可用的惟一双索引。预富集池高达12倍的测试。 | 12-plex(每次富集反应最多可收集12个样品) |
数量的反应 | 750或3000个反应 | 24或96个反应 | 自定义工作流:16或96个样本 | 48,96或288个样本 |
专门的样品类型 | 血液,FFPE组织 | 血液,FFPE组织 | 血液,FFPE组织,唾液 | 不兼容FFPE |
物种分类 | 任何物种,牛,狗,鸡,仓鼠,人,玉米,老鼠,羊,猪,大米,大豆,番茄 | 人类 | 人类,其他 | 人类 |