什么是测序质量评分?
测序质量分数测量底座被错误调用的概率。通过合成（SBS）技术进行排序，通过验证的算法分配了读取的每个基础1，2类似于最初为Sanger测序实验开发的。
测序技术视频
查看Illumina SBS如何工作。
问分数定义
给定基础的测序质量得分Q，由以下等式定义：
Q = -10日志10(e)
其中e是基调用出错的估计概率。
- 更高的Q分数表示误差概率较小。
- 问的得分越低可能会导致读取的很大一部分不可用。它们还可能导致更多的假阳性变异调用，从而导致不准确的结论。
如下图所示，质量得分为20表示错误率为1 / 100，对应的呼叫准确率为99%。
| 质量分 | 基本呼叫错误的概率 | 推断基础呼叫准确性 |
|---|---|---|
| 10 (Q10) | 1在10 | 90％ |
| 20 (Q20) | 1在100 | 99％ |
| 30日(Q30) | 在1000年1 | 99.9％ |
Illumina测序质量分数
Illumina测序化学提供高精度，具有绝大多数基础评分Q30及以上。这种精度级别是一系列测序应用的理想选择，包括临床研究。
yobet亚洲了解如何将PhiX用作Illumina NGS中运行质量监控的运行控制。
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参考文献
- Ewing B, Hillier L, Wendl MC, Green P.(1998):使用phred的自动音序器跟踪的基础调用。即精度评估。基因组研究》8 (3):175 - 185
- Ewing B, Green P.(1998):使用phred的自动音序器跟踪的基础调用。2错误概率。基因组研究》8 (3):186 - 194