RNA-Seq文库准备的进展正在彻底改变转录组的研究。
全转录组
测量基因和转录本丰度;检测编码和非编码RNA的已知和新特征。靶向杂交去除丰富的rRNA，集中在转录组的高价值部分。
信使核糖核酸
量化基因表达，识别编码转录组中已知和新的亚型，检测基因融合，并测量等位基因特异性表达。
RNA浓缩
分析一组重点关注的基因表达。提供定量表达信息以及检测小变异和基因融合。
RNA扩增子
使用聚合酶链反应(PCR)扩增子超深测序，分析感兴趣的RNA序列，差异表达分析，等位基因特异性表达测量，基因融合验证。
为你的实验选择一个RNA试剂盒
| 应用程序 | 产品 | 好处 |
|---|---|---|
| 总RNA序列 | Illumina链总RNA Prep |
|
| 信使rna序列 | Illumina链mRNA准备 |
|
| 有针对性的RNA序列 | Illumina RNA浓缩Prep |
|
RNA Library Prep at -a glance
| 应用程序 | 全转录组 | 信使核糖核酸 | RNA浓缩 |
|---|---|---|---|
| 实践时间 | < 3小时 | < 3小时 | < 2小时 |
| 周转时间 | ~ 7小时 | 6.5小时 | < 9小时 |
| 输入 | 1 ~ 1000ng标准质量RNA;10ng为最佳性能和FFPE样品 | 25 ~ 1000ng标准质量RNA | 10ng标准质量RNA;20ng RNA用于低质量/降解/ FFPE |
| 自动化功能 | 液体处理机器人 | 液体处理机器人 | 液体处理机器人 |
| PCR协议 | 没有 | 没有 | 是的 |
| 图书馆需要定量? | 是的 | 是的 | 是的 |
| 包括碎片? | 是的 | 是的 | 不是必需的 |
| 产品 | Illumina链总RNA Prep | Illumina链mRNA准备 | Illumina RNA浓缩Prep |
所有三种试剂盒都允许您通过在单个NovaSeq S4 Flow Cell上装载多达384个样品来降低测序成本，使用384个独特的双指标进行更高的通量测序。
标记的好处
串珠转座子标记技术是一项创新技术，应用于我们的图书馆制备组合。通过同时将gDNA片段化并添加Illumina测序引物，单粒标记可以让你比以前更快地获得序列就绪库。在没有辅助试剂或设备的情况下使您的图书馆正常化。减少周转时间和复杂性。
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理解适配器结扎
我们在NGS库准备中使用的另一项关键技术是适配器连接，它长期以来以一致性、高质量的数据而闻名。文库的制备方法是将gDNA或cDNA样本片段化，并将特定的适配器连接到片段两端。这些适配器包含测序引物杂交位点的全部补充。这消除了额外PCR步骤的需要，使过程完全自动化。
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我们将浏览您的需求并提出建议。
RNA-Seq文库准备方法和用例
两个套件的故事
两种流行的RNA文库预备试剂盒之间的关键比较揭示了RNA测序研究人员感兴趣的新信息。
RNA方法海报
一套全面的NGS分析方法:
- RNA转录
- rna蛋白质相互作用
- 低水平的RNA
- RNA的修改
- RNA结构
RNA的方法回顾
这篇文章集合描述了RNA测序的各种NGS方法，由科学文献汇编，包括正反两方面，发表摘要和参考文献。
用于免疫肿瘤研究的RNA测序示例工作流
图书馆准备
测序
分析
相关解决方案
索引
增加每次运行测序的样本数量，并使用唯一的双索引适配器优化高通量测序。
umi
独特的分子识别器(UMIs)提供错误校正和准确性，并可以减少假阳性变异调用，同时增加变异检测灵敏度。
自动化
我们的合作伙伴已经开发了高吞吐量和低吞吐量的自动化方法，这些方法跨越了我们的库准备组合。
RNA序列
在没有预先知识的情况下，在单一检测中检测已知和新的特征，包括转录本亚型、基因融合和单核苷酸变异。