对测序质量评分的介绍
测序质量分数衡量一个碱基被错误调用的概率。通过合成排序（SBS）技术，读取中的每个碱基通过类似phred的算法分配一个质量分数1，2，类似于最初为Sanger测序实验开发的。
测序技术视频
了解Illumina SBS如何工作。
问分数定义
给定碱基的测序质量评分Q由下式定义:
Q=-10log10(e)
其中e是基本调用出错的估计概率。
- 更高的Q分数表示较小的错误概率。
- 问的得分越低可能导致很大一部分读取不可用。它们还可能导致假阳性变异呼叫的增加，导致不准确的结论。
如下所示，质量分数为20表示出错率为1 / 100，对应的呼叫准确率为99%。
| 质量分数 | 基本呼叫错误的概率 | 推断基本呼叫准确度 |
|---|---|---|
| 10 (Q10) | 十分之一 | 90% |
| 20 (Q20) | 百分之一 | 99％ |
| 30日(Q30) | 在1000年1 | 99.9% |
Illumina测序质量分数
Illumina测序化学提供高精度，绝大多数碱基得分为Q30及以上。这一精度水平非常适合于一系列测序应用，包括临床研究。
yobet亚洲了解为什么PhiX可以用作Illumina NGS运行质量监控的运行控制。
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参考文献
- Ewing B, Hillier L, Wendl MC, Green P.(1998):使用phred的自动音序器追踪的基础呼叫。即精度评估。基因组研究》8 (3):175 - 185
- Ewing B, Green P.(1998):使用phred的自动音序器追踪的基础呼叫。2错误概率。基因组研究》8 (3):186 - 194