一个PhiX验证运行确认适当的硬件和软件性能的仪器。Illumina PhiX控制文库是一个具有相对平等的a、C、G和T核苷酸的平衡基因组。PhiX缺少索引，不是评估index Read性能的合适工具。下面是在Manual模式下为NextSeq™500/550系统设置PhiX验证运行的说明。手动模式允许您在不使用Local run Manager或BaseSpace™的情况下设置运行。

1. 打开NextSeq控制软件(NCS)
2. 选择实验
3. 选择序列
4. 选择手册
5. 编辑运行参数运行安装程序，下面是一个对端运行的示例:



注意:对于运行，将索引1和索引2都设置为零


6. 配置输出文件夹(参见如何连接台式仪器和本地运行管理器到网络位置支持公告)
7. 按照屏幕上的提示加载流单元格
8. 按照屏幕上的提示丢弃用过的试剂，重新装入用过的试剂托盘，并装入一个新的缓冲盒
9. 装入试剂盒
10. 检查运行配置
11. 接下来，执行仪器自检，然后PhiX验证运行开始排序

有关为NextSeq 500/550测序平台准备PhiX的更多信息，请参阅以下文档:

NextSeq 500/550系统变性和稀释库指南
在Illumina测序平台上验证PhiX加载浓度