一个PhiX验证运行确认适当的硬件和软件性能的仪器。Illumina PhiX控制文库来源于小型，特征良好的噬菌体PhiX基因组，是一个平衡良好的文库，a, T, G和C核苷酸的代表相对相等。PhiX缺少索引，因此不是评估index Read性能的合适工具。下面是设置MiSeq系统使用的PhiX验证运行示例表的说明Illumina实验经理(IEM) v1.15．

1. 打开Illumina实验管理器并选择创建示例表．
2. 选择MiSeq仪器和选择下一个．
3. 选择其他．
   
4. 选择FASTQ只然后下一个．
   

运行长度和参数取决于故障排除需求和试剂化学版本。如果使用MiSeq v2 50循环工具包，对于read 1和read 2，推荐的最小读取长度为26个循环。

欲了解更多关于Illumina实验管理器和为MiSeq测序平台准备PhiX的信息，请参阅以下文件:

• Illumina实验管理器用户指南
• MiSeq系统变性和稀释库指南
• 用于验证的PhiX加载浓度在Illumina测序平台上运行