本地运行管理器:如何在ISEQ,MiniSeQ或Miseq上设置Phix验证运行

09/04/18


Phix验证运行确认仪器的适当硬件和软件性能。Illumina phix控制库是一种良好平衡的基因组,具有相对等同的A,T,G和C核苷酸。phix缺少索引,不是评估索引读取性能的适当工具。

要在ISEQ,MiniSeQ或MiSeQ系统上设置Phix验证,请使用On-Instrument安装的本地运行管理器软件:

  1. 启动Chromium浏览器并在地址栏中输入HTTP:// localhost。如果启用了用户管理,将出现登录页面,要求您输入用户ID和密码。
  2. 选择创建运行,并选择重新开始从下拉列表中。

  3. 在突出显示的字段中输入以下值:
    • 运行的名字:phix验证运行
    • 图书馆准备套件:Truseq LT.
    • 索引阅读:0(注意:Phix未索引,选择1或2索引读数可能导致运行过早地终止)
    • 读类型:成对的结束
    • 读长度:输入至少26个周期
  4. 控件中保持默认值特定于模块的设置场地。


  5. 滚动到“创建运行”页面的底部。在导入样本表中,在phix中键入phix样本ID.场地。
  6. 在里面基因组文件夹字段,从物种列中选择phix。


  7. 选择保存运行。


  8. 关闭浏览器窗口并返回MiniSeQ控制软件。
  9. 选择phix验证运行从可用的运行列表中并继续排序。

    有关在MiniSeQ和Miseq平台上准备用于测序的Phix库的更多信息,请咨询MiniSeQ系统变性和稀释图书馆指南MISEQ系统变性和稀释库指南。