05/16/18
样品表可以编辑,FASTQ生成分析重新排序iSeq, MiSeq, HiSeq, NovaSeq运行上传到BaseSpace Sequence Hub.示例表是一个以逗号分隔的值(*.csv)文件,存储了设置、执行和从排序运行中生成多路分解fastq所需的信息。Illumina建议使用windows操作系统Illumina实验经理创建示例表的软件,因为它指导用户完成整个过程,并将检查错误。
有很多原因需要重新进行FASTQ Generation分析。例如,如果索引不正确地输入到示例表中(例如,反向补码),则必须更正索引并重新对数据进行多路复用。的技术故障诊断多路分解问题可以帮助用户诊断解复用问题。排队也可以用来转弯适配器修剪打开或关闭,或重新格式化示例表以删除任何非法字符。非法字符的例子是示例表的Sample ID字段中的空格或字母数字以外的任何字符、破折号或下划线。
注意:只有运行的所有者才能重新安排分析。这是可能的所有权转移如果有必要的话。一个共享的运行不提供重新申请分析所需的必要权限。
注意:在BaseSpace Sequence Hub中有两种数据聚合模式:CLASSIC和NEW。下面提供了两种模式的说明。要确定正在使用哪种模式或在模式之间切换,请使用仪表板页面右上角的拨动开关。
使用BaseSpace Sequence Hub的CLASSIC模式从iSeq、MiSeq、HiSeq或NovaSeq运行和requeue编辑示例表:
使用新BaseSpace Sequence Hub模式从iSeq、MiSeq、HiSeq或NovaSeq运行和requeue编辑样例表:
注意:BaseSpace Sequence Hub的用户最多只能尝试5次请求。如果需要其他requreques的帮助,请发送电子邮件给Illumina技术支持,并准备好分享您的运行ID和示例表。要找到运行ID,请在BaseSpace中打开运行,并在web浏览器地址栏中查看https://basespace.illumina/com/run/后的数值。
使用BaseSpace Sequence Hub PrepTab设置的MiniSeq和NextSeq 500/550运行需要不同的步骤来编辑运行设置和重新申请分析.MiSeq运行也可以在MiSeq Reporter中本地重新排队独立于BaseSpace Sequence Hub FASTQ生成。也可以在本地运行管理器中对iSeq运行进行本地重新排队。