随着其他最佳实践，使用独特的双重索引策略将确保您的库将以所有Illumina测序平台的最高精度序列和解复用。准备用于多路复用库时，Illumina鼓励客户在尽可能使用独特的双索引（UDI）。

关于唯一双索引你需要知道的:

• 唯一双索引是一种排序策略，对于i5和i7 index Read具有不同的、不相关的索引序列。
• 唯一的双索引是一种已知的缓解，用于过滤下游分析中出现的索引跳跃读取。错误的读取将被标记为“未确定的读取”，可以从分析中排除。有关跳指数的更多信息，请参阅白皮书指标错配对多路复用的影响及下游分析．
• 在连接步骤中使用唯一的双索引或非冗余索引，而无需对库准备工作流进行任何更改。
• 与组合双索引相比，惟一双索引具有完全惟一的索引(96惟一的i5和96惟一的i7s)。对于组合对偶索引，限制为8对唯一的对偶对，这导致大多数库在i5或i7端共享公共索引。
  

TruSeq独特的双索引工具包

产品名称	产品目录号	索引、样品
IDT为Illumina - TruSeq DNA UD索引	20020590	24个指标, 96样本
IDT为Illumina - TruSeq DNA UD索引	20022370.	96个索引, 96样本
IDT为Illumina - TruSeq RNA UD索引	20020591	24个指标, 96样本
IDT为Illumina - TruSeq RNA UD索引	20022371.	96个索引, 96样本

笔记：

• TruSeq DNA包括TruSeq DNA PCR-Free, TruSeq DNA Nano和TruSeq DNA外显子组。
• TruSeq RNA包括TruSeq链mRNA和TruSeq链总RNA。Nextera兼容的UDI预计在2018年底。

有关Illumina适配器序列的完整列表，请参阅Illumina公司适配器序列文档。