MiSeqDx囊性纤维化检测由两种不同的fda批准的、CE-IVD标记的CF检测试剂盒组成:MiSeqDx囊性纤维化139-Variant assay(目录编号:MiSeqDx囊性纤维化临床测序分析(目录号:dx102 -1004)。dx - 102 - 1001)。这些产品于2013年推出，使用MiSeqDx测序系统和MiSeqDx试剂试剂盒v1。这两种检测方法都使用一种提供文库准备和测序试剂的耦合试剂盒溶液。
TruSight囊性纤维化结合MiSeqDx囊性纤维化检测到一个fda监管的检测。TruSight囊性纤维化(目录编号:;20036925)将TruSight囊性纤维化139变异分析和TruSight囊性纤维化临床测序分析结合为一个库准备产品，提供两种测试选项。TruSight囊性纤维化需要使用MiSeqDx测序系统和MiSeqDx试剂盒v3(目录号:20012552)。MiSeqDx Reagent Kit v3测序试剂不随文库准备试剂盒一起提供，必须单独购买。
有关更详细的信息，请参阅TruSight囊性纤维化包插入(文件编号:;1000000097720)和数据表。这些文档可以在产品支持网站上找到。
TruSight囊性纤维化139- variant Assay是一种定性体外诊断方法，可同时在从人类外周血全血标本中分离的基因组DNA中检测139个临床相关的CFTR基因引起的突变和变异。测试的目的是:
TruSight囊性纤维化临床测序试验是一种体外诊断的靶向测序试验，从新测序从人外周血中分离的基因组DNA中CFTR基因的蛋白质编码区和内含子/外显子边界。测试的目的是:
是的，制备的文库以稀释扩增子文库(DALs)的形式储存，可在制备后28天内使用。用于TruSight囊性纤维化139变异分析和TruSight囊性纤维化临床测序分析的文库之间没有差异。
不，该检测方法未被验证用于干燥的血斑。干血点所含的DNA少于推荐量，可能导致比全血更低的呼出率。
从全血中提取的DNA是所需的样本类型。
任何经过验证的样品提取方法都可以使用。
所需的样本输入是从全血中提取的250ng DNA。DNA输入范围从25纳克到1250纳克已用于产生准确的结果。
必须准备至少24个库，并将其合并以进行排序。如果不是所有测序库都需要报告，用户可以准备不包括其中一些样本的样本表。
TruSight囊性纤维化工作流程提供了在每个库准备事件中准备多少样本和为每个测序事件汇集多少样本的灵活性。以下是一些可能的组合:
如果测序运行失败可归因于仪器问题，则可以重新对现有库进行测序。如果阴性对照调用率为> 10%，且上一趟井没有进行模板线清洗，则建议操作人员使用模板线清洗完成下一趟井后清洗，并重复测序下一趟。其他故障，如库准备期间的污染导致负控制调用率为> 10%，或阳性或野生型控制中的错误变量调用，将需要新的库准备。
模板行清洗对于限制运行到运行的结转是必不可少的。如果不进行清洗，则阴性对照样本的调用率可能会升高。如果不进行洗涤，DNA样本结果不会受到影响。
由于珠的归一化，不需要测量池库浓度。清理后的PCR产物可用于样品失效时的故障排除工作，通过对每个感兴趣的样品进行凝胶电泳，使用2-4% TBE琼脂糖凝胶和100 bp阶梯，以确认存在300-400 bp的库产品。如果需要纠正任何池化错误，存储板(SGP)最多可以在三天后用于重新池化和重新排序。
是的，当患者具有非典型或非经典的CF表现，或当其他突变组未能识别两种致病突变时，可以使用TruSight囊性纤维化临床测序分析。
两种TruSight囊性纤维化检测均设计用于MiSeqDx试剂盒v3。MiSeqDx v3测序流池已经过验证，每次测序可支持24-96次检测。TruSight囊性纤维化已被验证支持每个流式细胞运行至少24个样本。
必须准备至少24个库并将其池化以进行排序，但是可以选择一个子集进行requeue分析。每个样本必须有一个唯一的索引组合，但对使用哪种索引组合没有限制。
不，MiSeqDx囊性纤维化文库制剂的说明书要求用户使用MiSeqDx囊性纤维化试剂盒提供的测序试剂。
当测序运行完成时，将会有一个包含所有测序文件的输出文件夹。这个路径可以在本地运行管理器的“测序信息”选项卡中找到。在该路径中，有一个“Alignment_#”文件夹，其中包含一个压缩文件。解压文件后，VCF和BAM文件就可用了。FASTQ文件在本地驱动器上可用(在MiSeqDx计算机上)。默认路径是D:\Illumina\MiSeqAnalysis\{RunID}\Data\Intensities\BaseCalls。
包括BCL、FASTQ和VCF文件用于长期存储。