DRAGEN单细胞RNA管道

的DRAGEN单细胞RNA (Single-Cell RNA, scRNA) Pipeline可以处理多路单细胞RNA- seq数据集，从reads到逐细胞的UMI计数基因表达矩阵。管道与库设计兼容，其中一个读取片段匹配转录本，另一个包含单元条形码和UMI。管道包括以下函数:

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RNA-Seq(剪接感知)比对和匹配注释基因的转录片段。

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条形码读取时的单元条形码和UMI错误校正。

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UMI计数每个细胞和基因测量基因表达。

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稀疏矩阵输出和QC度量。

与比对和基因注释相关的功能和选项与RNA-Seq管道相同。信息,请参阅DRAGEN RNA管道．单细胞RNA不支持其他RNA- seq模块，如基因融合调用或转录水平的基因表达定量。