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HiSeq X Ten是10个超高通量HiSeq X测序系统的集合。HiSeq X Ten每年可以测序超过18000个基因组,每个基因组的价格不到1000美元。
每个系统可以在不到3天的时间内生成1.6-1.8 Tb, 2 × 150 bp的碱基约为Q30的75%以上。这个吞吐量使得每个系统每次运行可以覆盖16个基因组30倍。有关更多信息,请参见HiSeq X系列规格.
HiSeq X系统用于使用TruSeq Nano DNA (HT或LT)或TruSeq DNA PCR-Free (HT或LT)文库准备试剂盒的大规模全基因组测序项目。HiSeq X系统不兼容或不支持其他应用程序。
使用TruSeq纳米DNA或TruSeq DNA PCR-Free文库准备套件。支持350 bp或450 bp的插入。有关更多信息,请参见HiSeq X系统兼容产品.
Illumina不支持其他库准备方法或对Illumina协议的更改,也不保证不支持的方法的系统性能。
HiSeq X系统支持TruSeq Nano DNA和TruSeq DNA PCR-Free文库的插入大小分别为350 bp和450 bp。
HiSeq X Reagent Kit v2.5要求HiSeq X Control Software v3.1或更高版本。
HiSeq X系统采用图形流池技术。HiSeq X Reagent Kit中提供的试剂是为HiSeq X流池设计和优化的。为其他HiSeq模型设计的非模式流单元和SBS工具包尚未经过验证,HiSeq X系统不支持使用它们。
不。HiSeq X试剂是为HiSeq X系统设计和优化的。HiSeq X试剂与其他HiSeq型号不兼容。
一个有图案的流池有数十亿有序的纳米孔,这些纳米孔被制造到流池玻璃中。有序井允许以有序的排列方式生成序列簇。集群更紧密地排列在一起,增加了输出读取的数量和生成的序列数据的数量。
HiSeq X图形流池包含8道,与HiSeq高输出流池具有相同的一般尺寸。
不。HiSeq X流池的设计和优化用于HiSeq X系统。HiSeq X流池与其他HiSeq型号不兼容。
每个试剂盒包括两个流动细胞和所有所需试剂,包括聚类、SBS、成对端和标度试剂。一个试剂盒提供消耗品,150周期配对端(2 ×150 bp)测序运行,并在流细胞a和流细胞B上标度。
随着HiSeq X试剂试剂盒v2的发布,一个新的试剂盒配置称为10-pack试剂盒可用。10-pack套件包括流池和消耗品,用于10次双流池运行或20次单流池运行。10-pack设计用于一次支持4个流动细胞的制备和测序,并显著降低存储需求。
HiSeq X Reagent Kit v2要求HiSeq X Control Software v3.1或更高版本。
不。HiSeq X Reagent Kit v2.5具有与HiSeq X Reagent Kit v2相同的工作流程。HiSeq X Reagent Kit v2.5在cBot上聚类之前的试剂制备过程中使用相同的库变性步骤。变性步骤结合增强排除扩增(ExAmp)试剂,可以在HiSeq X系统上对TruSeq DNA PCR-Free文库进行测序,此外,数据质量和覆盖率也更高。
HiSeq X支持的读取长度为2 X 150 bp加上两个索引读取,每个8 bp。
HiSeq X控制软件v3.5.0(或更高版本)支持8 bp单标度和8 bp双标度。HiSeq X系统上的双索引测序需要HP14,一个i7和i5引物混合物。有关更多信息,请参见HiSeq X系统指南.
职位 |
交付的数量 |
8 SBS的位置 |
74毫升 |
10 paired-end位置 |
52毫升 |
所有职位 |
每道15.75毫升 |
通常每月更换含有保养洗涤液的洗涤瓶和软管就足够了。通常每六个月更换一次装有水的洗涤瓶和软管,尽管水大约每周更换一次。
是的。SAV 1.8.37或更高版本需要从HiSeq X运行中查看数据。你可以下载SAV用于网络计算机或在BaseSpace序列集线器中使用SAV。
使用Hiseq X控制软件V3.1或更高版本,使用Hiseq x试剂盒V2或Hiseq x试剂盒V2.5。测序Truseq DNA PCR无需文库需要V3.1。
图书馆类型 |
试剂包版本 |
控制软件版本 |
TruSeq DNA |
任何HiSeq X试剂盒 |
v3.0,或晚 |
TruSeq DNA PCR-Free |
HiSeq X v2试剂盒,或更高版本 |
v3.1,或晚 |
您可以预期超过75%的碱基以上Q30与2 x 150 bp运行使用以下库:
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