全部折叠
|全部展开
是的。NextSeq试剂盒具有专门用于Read 1, Read 2和索引定制引物的储层。看看nextseq系统自定义inchers指南(文档#15057456).
可以在nextseq上运行的库的数量仅受可用索引数的限制。库的多路复用允许您在索引使您将数据移回(DE-Multiplex)的情况下汇集多个样本。多路复用库从NextSeq试剂盒上的单个储存器转移到流动池上。
Nextseq V2试剂支持测序550bp的插入尺寸。使用NextSeq V1试剂,支持350bp的插入尺寸。
NextSeq 500/550试剂盒包括配对测序试剂和配对流式细胞。但是,当运行被设置为单读运行时,在成对端流单元上进行单读运行是可能的。
NextSeq流单元包含四个物理通道。但是,库是从单个存储库加载到流单元上的。您可以对流单元上的单个库或多个池库进行排序。
该化学允许我们在环境温度下运送流动细胞。接收时,将流动电池储存在2°C至8°C。
文件在NextSeq控制软件(NCS)中预加载。访问Beadchip扫描配置屏幕上的文件。看看NextSeq 550系统指南(文件#15069765).
支持的珠芯片包括Cytosnp-850k,Humancytosnp-12,Humankaryomap-12和Infinium甲基化珠状珠。
每个BeadChip扫描时间大约为40分钟。扫描时间可以根据样品的数量和BeadChip的类型而变化。欲了解更多信息,请参见数据表NextSeq 550测序系统.
使用DMAP解码文件客户端实用程序下载计算机上的解码文件客户端,可以访问DMAP文件夹的网络位置。文件客户端使您可以使用标准HTTP协议直接从Illumina服务器下载DMAP文件。
不,因为珠芯片和流动单元使用相同的成像组件。
运行持续时间取决于流单元的类型和循环的数量。例如,运行时,请参见数据表NextSeq 550测序系统.NextSeq 500系统和NextSeq 550系统的运行时间相同。
本地运行管理器运行模式 - 不需要样品表。
手动运行模式 - 以下情况下需要样品表:
对于NCS 2.2或更早的版本,只有在使用转换过的FASTQ文件和第三方分析软件的独立模式下,才需要样本表。使用Illumina实验管理器创建一个样本表。
运行NCS v4或更高版本的NextSeq 550系统可以使用本地运行管理器软件模块进行在线分析。
BaseSpace序列集线器上提供了其他分析工具。您还可以配置NextSeq System,以便将数据传输到本地服务器,并使用第三方软件执行分析。
如果在运行期间中断数据传输,则数据传输暂时存储在仪器计算机上,直到恢复连接。恢复连接时,将自动传输数据恢复。
如果在运行结束前没有恢复连接,则必须手动从仪器计算机中删除数据,然后才能开始后续运行。
这是Illumina的国际网站。如果您正在寻找特定于您所在地区的信息,请选择您的位置,我们将重定向您。