在准备样本库之前,请使用您的测序系统的一个选项记录您的样本信息:
Illumina的AmpliSeqBRCAPanel是一种针对体细胞和种系变异研究的重测序分析乳腺癌易感基因1和BRCA2基因。详细规格请参见Illumina BRCA面板的AmpliSeq.
池数量 | 专注 | 数量的扩增子 | 平均扩增子长度(bp) | 平均库长(bp) |
---|---|---|---|---|
1 | 5倍 | 265 | 98 | 238 |
完成Illumina的AmpliSeqBRCA方案要求面板和以下图书馆准备工具包和索引工具包。AmpliSeq for Illumina Library PLUS试剂盒有24-,96-和384-反应配置。
对于每个DNA样本,Illumina的AmpliSeqBRCA面板生成一个DNA库。样本是一个来源的核酸的标本,而文库是样品制备后的核酸。一个库具有测序所需的端点。
准备合适数量的样品需要以下试剂盒的数量和组合。
数量的样品 | 24样本 | 96样本 | 384个样本 |
---|---|---|---|
图书馆数量 | 24岁的库 | 96个图书馆 | 384个图书馆 |
Illumina BRCA面板的AmpliSeq | 1 | 4 | 16 |
扩大仪库加上Illumina | 1 24-反应试剂盒 | 1 96年-反应设备 | 1 384年-反应设备 |
扩增CD设置A(96反应,96个索引) | 1 | 1 | 4 |
互补脱氧核糖核酸的合成 | 不适用 | 不适用 | 不适用 |
Illumina的序列扩增BRCA库使用以下系统和试剂盒。
系统 | 试剂盒 | 每运行库 |
---|---|---|
MiSeq系统 | MiSeq试剂纳米试剂盒v2 | 32 |
MiSeq Reagent Micro Kit v2 | 96 |
系统 | 试剂盒 | 每运行库 |
---|---|---|
MiniSeq系统 | mineq中输出试剂试剂盒 | 24 |
mineq高产量试剂试剂盒 | 80 | |
MiSeq系统 | MiSeq试剂纳米试剂盒v2 | 3. |
MiSeq Reagent Micro Kit v2 | 12 | |
MiSeq试剂试剂盒v2 | 48 | |
MiSeq试剂试剂盒v3 | 80 |