在准备库之前，使用测序系统可用的选项记录有关样本的信息：
Illumina儿童癌板的扩增提供了针对儿童和年轻成年癌症相关的体细胞变异的靶向重组解决方案。
| 组件 | 数量的池 | 浓度 | 数量的扩增子 | 平均扩增子长度（BP） | 平均库长度（bp） |
|---|---|---|---|---|---|
| DNA | 2 | 4x. | 3069 | 114 | 254 |
| 核糖核酸 | 2 | 5倍 | 1701 | 122 | 262 |
完成针对Illumina儿童癌症小组的AmpliSeq方案需要小组和以下文库准备、cDNA合成和索引试剂盒。Illumina Library PLUS套件的AmpliSeq有24、96和384种反应配置。
Illumina儿童癌症小组的AmpliSeq为每个样本生成一个DNA和一个RNA库。样本可以是DNA、RNA或配对的。本协议的样本是成对的。样本是来自一个来源的核酸标本，而库是制备后的样本的核酸。文库是一种独特的DNA或RNA制剂，具有测序所需的末端。
准备适当数量的样品需要以下数量和试剂盒的组合。
| 数量的样品 | 24个样品 | 96个样本 | 384个样本 |
|---|---|---|---|
| 数量的图书馆 | 48个图书馆 （24 DNA，24 RNA） |
192库 （96 DNA，96 RNA） |
768库 （384DNA，384RNA） |
| Illumina儿童癌症委员会AmpliSeq | 1 | 4 | 16 |
| AmpliSeq Library PLUS For Illumina | 2 24-反应试剂盒 | 2包96 -反应 | 2 384-反应试剂盒 |
| AmpliSeq CD Set A(96个反应，96个指标) | 1 | 2 | 8 |
| cDNA合成 | 1 | 1 | 4 |
Illumina儿童癌症小组库的序列AmpliSeq使用以下系统和试剂包。
| 系统 | 试剂盒 | 马克斯# DNA 仅按每次运行样本 |
最大#RNA. 仅按每次运行样本 |
马克斯#结合* 样品每运行 |
受到推崇的 合并* DNA：RNA汇集 体积比* * |
运行 |
|---|---|---|---|---|---|---|
| MiniSeQ系统 | MiniSeq中输出试剂试剂盒 | 1 | 8 | 1 | 5:1 | 17个小时 |
| MiniSeq高输出试剂盒 | 5 | 25 | 4 | 5:1 | 24小时 | |
| 米塞克系统 | MiSeq试剂盒v2 | 3. | 15 | 2 | 5:1 | 24小时 |
| MiSeq试剂盒v3 | 5 | 25 | 4 | 5:1 | 32小时 | |
| NextSeq系统 | NextSeq Mid Output v2 Kit | 27 | 96. | 22 | 5:1 | 26小时 |
| NextSeq高输出v2套件 | 83. | 96. | 48. | 5:1 | 29个小时 |
*结合是指从同一样本中配对的DNA和RNA，产生两个文库，分别由每个核酸和分别索引。
**基于推荐读取覆盖率的组合DNA与RNA池比率。