问题和答案

该测定中使用的适配器针对SomexiSeQ工作流进行了优化。Nextera或Truseq适配器与该测定不兼容。

看内容和存储．

可以在相同的测序运行中运行3个不同的AmpleDiseq for Illumina设计。但是，必须在一次运行中实现您的目标放大器大小和所需的覆盖范围。

建议使用2×151 BP配对读数。

看产品的兼容性．

您可以通过增加测序吞吐量（例如，更大的流量小区输出或测序平台）来操纵覆盖范围，或减少每次运行池汇总的样本数量。

本地运行管理器和Basespace序列集线器具有可用于分析的应用程序。DNA扩增子分析APP和RNA扩增子分析应用程序可在Basespace序列集线器上提供。可以使用BaseSace Variant Interpreter对任何变体呼叫执行进一步分析。本地运行管理器具有类似的DNA扩增子分析模块和RNA扩增子分析模块，其利用与Basespace序列集线器应用程序相同的工作流程和算法。

DNA扩增子分析工作流可用于执行比对和变异调用，RNA扩增子分析工作流可用于融合调用。此外，OncoCNV调用，一个BaseSpace Lab应用程序可用于CNV分析。

对于实验的示例数据，请转到公共数据BaseSpace页面。

使用BaseSpace DNA扩增子2.0或更高版本，局部运行管理器DNA扩增子分析模块V1.1或更高可用于分析样本ID。

示例ID清单信息是使用Basespace DNA扩增子2.0和本地运行管理器DNA扩增子分析模块V1.1。用户只需要单击“示例ID”选项进行分析。此外，示例ID清单文件可在SalkISeQ中可用Illumina Panel下载在支持网站中的部分。

在目标基础上显示总测序碱基的百分比，该碱基映射到参考基因组中的靶区域。该度量反映了A）从扩增子的基础的百分比被设计，合成和汇集和B)生成序列数据映射到目标区域。