在准备库之前,使用可用的选项记录有关样本的信息nextseq 550系统。
Illumina Exome Coare的扩增使得PCR的速度和简单性与外壳测序,允许研究人员在一次运行中序列八个凸形并快速识别种系变体。
池数量 | 扩增子数量 | 平均扩增子长度(BP) | 平均图书馆长度(BP) |
---|---|---|---|
12. | 293,908 | 205. | 345. |
完成Illumina Exome面板协议的SomexiSeq要求面板和以下库准备和索引套件。Illumina Library Plus套件的AmpliSeq在24-,96-和384和384-反应配置中提供。Illumina套件的SomexiSeQ CD指数可用于该面板所必需的大容量配置。
对于每个DNA样品,Illumina外壳组的扩增率为1个DNA文库。样品是来自一个源的核酸样品,而文库是在制备后的样品中的核酸。图书馆具有测序所需的末端。
准备适当数量的样本需要以下数字和套件组合。
样本数量 | 8个样本 | 32个样本 | 128样本 |
---|---|---|---|
图书馆数量 | 8个图书馆 | 32个图书馆 | 128个图书馆 |
Illumina Exome Panel的SomexiSeq | 1 | 4. | 16. |
扩大仪库加上Illumina | 1 24-反应试剂盒 | 1 96-反应试剂盒 | 1 384-反应套件 |
扩增CD设置A(96反应,96个索引) | 1 | 1 | 2 |
cDNA合成 | 不适用 | 不适用 | 不适用 |
使用以下系统和试剂盒的Illumina Exome面板库的序列扩展。
系统 | 试剂盒 | 每个运行的样本 |
---|---|---|
nextseq系统 | nextseq中产输出v2套件 | 2 |
nextseq高输出v2套件 | 8. |