问题&答案

本分析中使用的适配器针对AmpliSeq工作流程进行了优化。Nextera或TruSeq适配器与本分析不兼容。

看见内容和存储．

对于稀有克隆，建议输入量为1000ng。

可以为Illumina设计运行3个不同的AmpliSeq，每个都在同一序列运行中使用条形码。但是，您的目标放大器大小和所需的覆盖率必须在一次运行中实现。

推荐使用2×151 bp对端读取。

可测序的样本数量高度依赖于样本的T细胞克隆多样性。

是的，Illumina建议在PhiX对Jurkat等多样性较低的样品进行加价。遵循适当的变性和稀释指南(≥5%)为您的测序系统。

您可以通过增加测序吞吐量（例如，更大的flow cell输出或测序平台）或减少每次运行收集的样本数来操纵覆盖率。

Illumina推荐使用BaseSpace Sequence Hub中的第三方MiXCr Labs应用程序。

有关实验数据的示例，请转到公共数据在BaseSpace页面。

靶上碱基显示了在参考基因组中映射到靶区域的总测序碱基的百分比。这个指标反映了扩增子中a)被设计、合成和汇集的碱基的百分比和B)生成序列数据映射到目标区域。