用于Illumina免疫应答面板常见问题解答的AmpliSeq

本分析中使用的适配器针对AmpliSeq工作流程进行了优化。Nextera或TruSeq适配器与本分析不兼容。

请参阅目录和存储。

可以为Illumina设计运行3个不同的AmpliSeq，每个都在同一序列运行中使用条形码。但是，您的目标放大器大小和所需的覆盖率必须在一次运行中实现。

推荐使用2×151 bp对端读取。

看到产品的兼容性。

您可以通过增加测序吞吐量（例如，更大的flow cell输出或测序平台）或减少每次运行收集的样本数来操纵覆盖率。

RNA扩增子分析流程可用于差异表达分析。RNA扩增子分析应用程序可在BaseSpace Sequence Hub上使用。本地运行管理器有一个类似的RNA扩增分析模块，它使用与BaseSpace序列集线器应用程序相同的工作流和算法。

是的，在BaseSpace公共数据中有示例数据集。

在目标基础上显示了参考基因组中的靶区域的总测序碱基的百分比。该度量反映了A）从扩增子的基础的百分比被设计，合成和汇集和B)生成序列数据映射到目标区域。