在准备库之前，请使用您的测序系统可用的选项记录您的样品信息。
无论复杂性如何，完成Nextera XT DNA协议需要库准备试剂盒和兼容的索引试剂盒。Nextera XT Index Kit v2将取代淘汰的Nextera XT Index Kit(96个索引，384个样本)(FC-131-1002)。
在库制备后，使用适用指南中的说明变性并稀释库到适当的加载浓度。
下表提供了在Illumina系统上进行测序的推荐周期数Illumina Nextera DNA UD指数的IDT(10 bp)。
对于MiniSeq和NextSeq系统，试剂盒rfid编码最大次数的循环。当每个Index read需要10个周期时，最大值不允许read 1和read 2的完整读长度。因此，对整个读长度进行排序需要分别从read 1和read 2中减去两个周期。Illumina预计将在2019年上半年修改RFID编码，以允许额外的测序周期。
| 测序系统 | 阅读1 | 指数1 | 指数2 | 阅读2 |
iSeq 100, MiSeq v2, HiSeq 2500/3000/4000, NovaSeq 6000 |
151 |
10 |
10 |
151 |
| MiniSeq NextSeq 500/550 | 149 |
10 |
10 |
149 |
| MiSeq v3 | 301 | 10 | 10 | 301 |