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是的。然而,我们已经看到使用一些商业上可用的小RNA自旋柱纯化方法的高样本可变性,任何纯化方法的验证都可能是必要的。如果使用纯化的小RNA作为起始材料,则应使用10-50 ng。
以1 μg总RNA为优化条件。
读取长度超过小RNA分子将序列插入适配器的长度。出于这个原因,我们建议只对足够的周期进行测序,以覆盖感兴趣的小RNA,或者在对齐之前修剪后面的周期。此处给出了从3'端开始需要修剪的顺序,以供参考。
TGGAATTCTCGGGTGCCAAGGAACTCCAGTCACnnnnnnATCTCGTATGCCGTCTTCTGCTTG
这是给出的指标特异性引物序列的反向补充Illumina适配器序列文档,索引序列为nnnnnn。
与任何分子生物学技术一样,方案的改变将改变绝对结果。我们不建议在不同的准备方案之间比较绝对计数(或归一化为总计数的计数)。然而,比较两种方案之间的折叠变化应产生良好的相关性。
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