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索引序列与TruSeq LT单索引适配器AR001-AR027相同。有16个默认索引适配器和8个备用索引适配器。
NeoPrep适配器与手动适配器不可互换,因为它们的配方适合在数字微流体环境中工作。有关更多信息,请参阅TruSeq绞合mRNA库准备NeoPrep参考指南.
这套工具包包括三个盒子。箱1在室温下保存,箱2在-25℃~ -15℃下保存,箱3在2℃~ 8℃下保存。
使用TruSeq mRNA NeoPrep试剂盒制备的文库可在-25°C至-15°C下储存长达两个月。
Illumina建议总RNA为25-100 ng。
这个过程从总RNA开始。RNA纯化珠用于结合poly-A mRNA,然后将其装载到文库卡上。用其他方法纯化的mRNA或没有poly-A尾巴的总RNA都不起作用。
使用安捷伦技术人UHR总RNA(目录# 740000)作为本协议的阳性对照样本。
假设推荐的输入量和质量,NeoPrep上的TruSeq链mRNA协议从文库卡上收集文库液滴,在RSB中稀释,并从油中分离后,得到10µl 10 nM的文库。这种测量是基于荧光定量。
该协议可以包括库准备、库准备和量化,或库准备、量化和规范化。报道的定量和归一化值说明了RSB中的库稀释。
该方案在10.5小时内准备库,包括库准备、量化和标准化。运行开始后无需干预,库在采集前可在仪器上保留3天。