TruSight肿瘤500高通量兼容产品

兼容测序系统

兼容的分析软件

DRAGEN TSO 500分析软件v1.1。

TSO 500本地应用程序v2.1兼容v1测序耗材。

TSO 500 Local App v2.2兼容v1和v1.5测序耗材。

TruSight Oncology 500高通量试剂盒的阅读长度

读/索引 循环次数
阅读1 101
指数1 10
指数2 10
阅读2 101

TSO 500 HT数据的单台DRAGEN服务器分析

每个DRAGEN服务器的样本 总周转时间(小时)
8个组织活检样本 2小时
16个组织活检样本 3个小时
32个组织活检样本 5个小时
16个组织活检样本 10个小时

基于TSO 500 v2.1本地应用的多节点TSO 500 HT数据分析

本表基于来自NovaSeq S2流式细胞的72对DNA/RNA样本。
每个节点的样本 总周转时间(小时)* AWS实例类型 个vCPU实例 实例内存(GiB)
8 3.67 c5_9xlarge 36 72
16 6.76 c5_9xlarge 36 72
24 10.17 c5_9xlarge 36 72
32 13.68 c5_9xlarge 36 72
48 21.00 c5_9xlarge 36 72
72 30.60 c5_9xlarge 36 72
8 1.73 c5D_18xlarge 72 144
16 3.23 c5D_18xlarge 72 144
24 6.87 c5D_18xlarge 72 144
32 9.20 c5D_18xlarge 72 144
48 14.47 c5D_18xlarge 72 144
72 23.33 c5D_18xlarge 72 144

*多路分解。NovaSeq S2流单元的平均解复用时间为3-4小时。

库的数量和选择索引

为了获得最佳的覆盖范围,对于每次测序运行的库数量,请使用以下指南。

NovaSeq 6000
流动单元 最低 最大
SP

8 DNA

8 RNA

16 DNA

16个RNA

S1

16 DNA

16个RNA

32 DNA

32 RNA

S2

32 DNA

32 RNA

72个DNA

72年RNA

S4

72个DNA

72年RNA

192个DNA

192年RNA

NextSeq 500, NextSeq 550, NextSeq 550Dx在RUO模式
流动单元 最低 最大

3 DNA

3 RNA

8 DNA

8 RNA