BaseSpace兼容产品

16 s宏基因组

16S宏基因组应用程序对16S rRNA靶向扩增序列进行分类。

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扩增子DS软件

Amplicon DS应用程序专为双链靶向重测序分析而设计,它将读取的数据与清单文件中指定的参考数据进行比对,然后进行变异分析。

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BWA浓缩应用

BWA浓缩应用程序对齐读取全基因组参考,然后对清单文件中指定的感兴趣区域进行变体分析。

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BWA全基因组测序应用程序

用于小基因组的全基因组测序,BWA全基因组测序应用程序将读取的数据与指定的参考数据进行比对,然后进行变异分析。

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浓缩的应用

富集应用程序(以前称为Isaac Enrichment)针对特定的目标序列分析被富集的DNA,比对特定的引用,然后对清单文件中指定的感兴趣区域执行变异分析。

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艾萨克全基因组测序应用

旨在用于小型基因组的全基因组测序,ISAAC全基因组测序应用对准指定的参考,然后执行变体分析。

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RNA表达的应用

RNA Express应用程序将RNA测序读数与特定基因进行比对,并进行差异表达。

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RNA-Seq校准程序

RNA-SEQ对齐应用对准RNA测序对特定参考的读取,使用Cufflinks组装和DE应用程序执行变体分析,基因融合检测和新颖的脚本组件。

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小RNA应用程序

Small RNA应用程序将读取的数据与污染物、成熟miRNA、小RNA和基因组参考数据库进行比对,然后测量短RNA序列的丰富程度。

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有针对性的RNA的应用

目标RNA应用对齐清单文件中指定的读数,量化样品之间基因和同种型的相对表达,然后对样品进行比较。

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TopHat和Cufflinks RNA-Seq应用程序

TopHat Alignment和Cufflinks Assembly应用程序比对特定参考的rna测序读取,进行变异分析,并估计参考基因和转录本丰度。

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TruSeq扩增子程序

TruseQ Amplicon App对齐读取读取在清单文件中指定的引用,然后执行变体分析。

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TruSeq Long读取程序集

TruSeq Long read Assembly App为长读测序生成库,并组装高质量的合成长读片段。

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TruSeq逐步应用

Truseq序列应用程序进行全人类基因组磷酸肽,使得能够产生单倍型片段以进行等位基因特异性分析。

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Trusight肿瘤15应用程序

TruSight肿瘤15应用程序对清单文件中指定的内容进行比对,然后报告一组与癌症相关的参考基因的体细胞变异。

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肿瘤的正常应用

肿瘤正常检测从一对匹配的肿瘤和正常样本的体细胞变异。

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TruSeq纳米DNA HT

TruSeq DNA PCR-Free HT

nextera xt.

nextera xt.

Nextera交配两

Nextera DNA

TruSeq纳米DNA HT

TruSeq DNA PCR-Free HT

TruSeq纳米DNA HT

TruSeq DNA PCR-Free HT

Nextera DNA