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完成本课程后,您将能够识别MiSeq运行设置选项,描述如何准备MiSeq试剂盒和加载库,并列出使用MiSeq控制软件(MCS)启动测序运行的步骤。
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在本课程结束时,您将能够:确定在NextSeq上开始运行的步骤,描述如何准备试剂盒,并使用NCS开始测序运行。
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| FASTQ文件存储生物序列和质量信息,是下游数据分析管道的关键。在FASTQ生成过程中需要执行几个步骤,以确保优化的数据分析。本次网络研讨会面向包括生物学家在内的新和中级用户,旨在了解用于处理FASTQs的基本生物信息学工具的输出结果。我们将专注于BaseSpace Sequence Hub工具,如FASTQC和FASTQ工具包*。
我们将讨论以下主题:什么是FASTQ文件;Illumina FASTQ生成工具概述FASTQ处理,如适配器修边,遮蔽,质量修边,读取拼接等;并强调Illumina运行性能指标与第三方工具(如FASTQC)生成的输出之间的差异。
*BaseSpace Labs应用程序使用加速开发过程,以使它们比传统的Illumina应用程序更快地提供给BaseSpace用户。Illumina可自行决定为BaseSpace实验室应用程序提供支持。BaseSpace Labs应用程序按原样提供,不提供任何类型的保证。使用BaseSpace Labs应用程序的风险由用户自行承担。Illumina不负责任何数据的丢失,不正确的结果,或任何成本,责任,或可能因使用BaseSpace Labs App而导致的损害。
| Local Run Manager是一款基于windows的Illumina台式测序数据软件,包括本地分析选项以及运行和用户管理。这次网络研讨会的目标是软件的新用户和中级用户。它将提供Local Run Manager 2的研究使用(RUO)版本的概述,包括仪器外版本和与最新的MiSeq控制软件、iSeq控制软件和NextSeq控制软件捆绑的版本。本次网络研讨会不包括该软件的Dx版本。我们将涵盖以下主题:Local Run Manager 2的特性,可用版本和分析选项,如何设置运行和分析数据,与仪器上控制软件的交互,以及与其他Illumina分析软件的比较。
即将到来的会议| Local Run Manager是一款基于windows的软件,用于Illumina台式测序数据,包括本地分析选项以及运行和用户管理。这次网络研讨会的目标是软件的新用户和中级用户。它将提供Local Run Manager 2的研究使用(RUO)版本的概述,包括仪器外版本和与最新的MiSeq控制软件、iSeq控制软件和NextSeq控制软件捆绑的版本。本次网络研讨会不包括该软件的Dx版本。我们将涵盖以下主题:Local Run Manager 2的特性,可用版本和分析选项,如何设置运行和分析数据,与仪器上控制软件的交互,以及与其他Illumina分析软件的比较。
美国太平洋标准时间2020年4月21日
即将到来的会议| Local Run Manager是一款基于windows的软件,用于Illumina台式测序数据,包括本地分析选项以及运行和用户管理。这次网络研讨会的目标是软件的新用户和中级用户。它将提供Local Run Manager 2的研究使用(RUO)版本的概述,包括仪器外版本和与最新的MiSeq控制软件、iSeq控制软件和NextSeq控制软件捆绑的版本。我们将涵盖以下主题:Local Run Manager 2的特性,可用版本和分析选项,如何设置运行和分析数据,与仪器上控制软件的交互,以及与其他Illumina分析软件的比较。
Local Run Manager是一个集成的解决方案,用于记录运行的样本,指定运行参数,监视状态,分析测序数据,以及查看结果。
格林尼治时间2020年4月30日
即将到来的会议请加入我们的演示,评估NextSeq 500/550作业产生的数据质量,以及改进和实现理想数据输出的最佳实践。本次网络研讨会的目标是NextSeq 500/550的新用户,以便使他们熟悉回顾问题的表型和潜在原因。本次网络研讨会将涵盖:NextSeq 500/550系统的特点和2色化学,NextSeq 500/550运行的预期数据输出;随着NextSeq 500/550控制软件v4.0的升级,使用测序分析查看器(SAV)检查数据,确定常见的运行问题表型和如何排除故障。我们还将在演示的最后安排一个提问和回答环节。
2020年4月24日
即将到来的会议评估运行产生的数据的质量并为理想的输出进行调整是排序过程的一个重要部分。本次网络研讨会面向NextSeq 550测序平台的新用户,回顾问题表型和潜在原因。我们将讨论以下主题:NextSeq 550系统的基本机制和NextSeq 2色化学;NextSeq 550的预期数据输出运行;升级到NextSeq控制软件v4.0的变化;我们可以从序列分析查看器收集的重要数据;几种常见的问题表型以及如何诊断它们。
太平洋标准时间2020年5月21日