miseq记者常见问题解答

完成MISEQ报告器分析时，将在“分析”选项卡的“状态”列中出现复选标记，并将完成的jobinfo.xml文件写入分析文件夹的根级别。

MiSeQ Reporter软件作为Web服务器运行，在Miseq计算机上连续运行。要查看当前的MiSeQ Reporter状态，请打开Web浏览器并输入以下URL：http：// pcname：8042（其中“PC名称”是MISEQ PC的名称或IP地址）。

如果在次要运行的次要分析之前在MISEQ系统上启动了新的排序运行，则会自动停止辅助分析。MISEQ计算资源专用于排序或分析，并且系统的设计是这样的方式，序列命令覆盖分析命令。稍后可以从MISEQ Reporter分析选项卡重新分析辅助分析。

MiSeQ Reporter需要访问存储库，该存储库是包含用于分析数据的文件夹的位置。您可以在MiSeq Reporter主屏幕上的“设置”窗口中设置此位置。当MiSeQ Reporter访问存储库时，您的运行将显示在MiSeq Reporter中的“分析”选项卡中。选择要分析的运行旁边的Refeue复选框，然后单击“重新点击”以开始分析。

对于2×250 BP运行，在Miseq上使用最新的PC RAM配置，分析大约需要3小时。重新排列的基因组大小也会影响分析时间。如果分析需要超过两个小时，请考虑将样本的更合适的参考，或者在另一台计算机上安装MiSeq Reporter来执行分析。

如果针对整个基因组进行对齐，则分析时间将显着长于两个小时。此外，对偏心组虫的生物信息学分析可能需要长达12小时。

不，辅助分析无法自动延迟。如果开始在MiSeQ系统上的后续排序运行，则会自动停止辅助分析。

MiSeQ Reporter在大多数分析工作流程中的次要分析期间生成FASTQ文件。要生成FASTQ文件，请在样本表中指定生成的FALEATEFAYS工作流，该工作流生成FASTQ文件，然后退出次要分析。