MiSeq Reporter需要以下主要分析文件来开始二次分析。软件自动访问运行文件夹中的这些文件。
| 文件类型 | 描述 |
|---|---|
| RTAComplete.txt | 指示RTA处理已完成的标记文件。 |
| SampleSheet.csv | 在排序运行的开始时提供。包含分析工作流程和重要的运行信息。 |
| RunInfo.xml | 标识高级运行信息。 |
| ＊.基类库文件 | 文件包含基本调用信息。 |
| * .Filter文件 | 文件包含每个图块的过滤器结果。 |
| ＊.loc文件 | 文件包含平铺上所有集群的位置。 |
| 数据库 | miRbase对人类 dbSNP对人类 refGene对人类 |
| 基因组 | 拟南芥蒂利亚纳 牛 大肠杆菌应变DH10b 人类 （智人)建立hg19 鼠标 老鼠 酵母 金黄色葡萄球菌 |
你可以上传和使用自己的参考FASTA格式。参考FASTA文件应该存储在一个单一的文件夹中，并且有一个*。足总或*。fasta扩展。