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| FASTQ文件存储生物序列和质量信息,是下游数据分析管道的关键。在FASTQ生成过程中有几个步骤是必要的,以确保最优的数据分析。本次网络研讨会面向包括生物学家在内的新中级用户,他们希望了解用于处理FASTQs的基本生物信息学工具的输出。我们将重点关注BaseSpace Sequence Hub工具,如FASTQC和FASTQ工具包*。
我们将涉及以下主题:什么是FASTQ文件;Illumina FASTQ生成工具概述FASTQ加工,如适配器切边,掩蔽,质量切边,读缝等;强调Illumina运行性能指标和第三方工具(如FASTQC)生成的输出之间的差异。
*BaseSpace实验室应用程序采用加速开发过程,以便让BaseSpace用户能够比传统的Illumina应用程序更快地使用它们。Illumina可自行决定为BaseSpace实验室应用程序提供支持。BaseSpace Labs Apps是按原样提供的,没有任何形式的保证。使用BaseSpace Labs应用程序的风险由用户自行承担。Illumina不对使用BaseSpace Labs应用程序可能导致的任何数据丢失、错误结果或任何费用、责任或损害负责。