NextSeq系统升级通过对NextSeq控制软件(NCS)版本4的更新来完成。NCS v4为NextSeq系统提供了几个增强，包括:
- 从Windows 7升级到Windows 10操作系统
- 本地运行管理器用于简化运行设置和载载分析
- 英飞纳姆MethylationEPIC阵列扫描能力（nextseq 550系统）
- 改善base-calling准确性
- 改进的BaseSpace序列集线器连接
- 改进的仪器性能监视
- 与NextSeq系统的所有Nextseq系统兼容，包括NextSeq 550dx *的研究模式
*为体外诊断使用。
升级过程
Illumina现场服务工程师必须到现场进行升级。要安排升级，请联系Illumina现场代表。以下是升级后的预期:
- 不需要做特别的准备，尽管您的IT部门应该被告知并知道内部计划的变更。
- 将更换NextSeq系统硬盘驱动器，从当前1 TB驱动到2 TB驱动器。
- 升级到NCS V4后，系统无法恢复到以前版本的NCS。NCS V4是Windows 10，基于Windows 7在Windows 7上运行的先前版本的NCS。
- 升级时间约为1-2天。
NCS v4中的管理员和非管理员权限
使用NCS V4，非管理员用户可以运行仪器控制软件。非管理员帐户有几个考虑因素：
- 需要通过客户IT管理对添加到NextSeq OS的帐户进行权限和访问管理。
- 控制软件只允许一次登录一个用户。因此，用户不应在活动排序运行期间退出帐户，以防止运行过早终止。
- 应避免和/或禁用远程登录（如RDP，SSH，TELNET）以避免过早运行终止（如上所述）。
- 管理员帐户登录，系统会提示某些情况下，如安装软件，包括本地运行管理器模块。
- 只有管理员才能对C:驱动器进行读写访问;非管理员用户将具有只读访问权限。
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