作为升级到NextSeq控制软件（NCS）V4的一部分，NextSeq系统将接收本地运行管理器，该管理器是用于管理序列运行的集成软件解决方案。本地运行管理器与仪器控制软件集成，可以直接在NextSeq系统上访问或远程运行。
本地运行管理器启用用于设置样本，运行和分析的简化，用户友好的界面，以及查看分析结果。它还支持导入和导出样本表。用户管理包括权限设置和审计跟踪。用于分析各种库类型的多个分析模块可用于本地运行管理器。
本地运行管理器是仪器软件套件的一部分，不需要单独安装。
如果您的仪器连接到互联网，您可以下载模块文件，并直接安装到本地运行管理器系统。的分析模块分别下载本地运行管理器软件下载Illumina支持网站上的页面。
本地运行管理器支持以下分析模块。*每个模块的参考指南描述了模块所基于的分析管道。
*此外，还有各种各样的第三方分析解决方案，每一个都有一组独特的功能和限制。建议在每个项目的基础上评估潜在的解决方案，以确定最合适的。
通过升级到NCS v4，将项目上传到Basespace序列集线器需要您在本地运行管理器中设置运行而不是在Prepab中设置。在BaseSpace序列集线器上生成的数据使用prep tab与运行设置的本地运行管理器相同。如果您计划在仪器上使用本地运行管理器，我们建议您将输出与先前的数据进行比较，以通过准备标签生成，因为某些模块可能不同的基于仪器和基于云的分析。