Hiseq 2500系统的关键方法

外显子组、靶向重测序、全转录组和从头测序、表观遗传调控等

HiSeq 2500应用与方法

外显子组测序分析基因组的蛋白质编码区,作为全基因组测序的一种经济有效的替代方法。HiSeq 2500系统具有快速运行和高输出模式,是一个灵活的系统,可以测序5-75外显子组*每次运行。

*假设100x覆盖率,80%目标使用2 x 75 bp读取。

通过总RNA测序(RNA- seq)分析编码RNA和多种形式的非编码RNA,以全面了解转录组。HiSeq 2500系统使用HiSeq v4化学试剂,每次双流细胞测序可达40亿reads,每次测序最多可测序80个转录组。

*假设每个样本读取5000万次。

看看研究人员如何在HiSeq系列中使用总RNA-Seq。

基因表达分析

mRNA测序(mRNA- seq)检测已知的和新的转录本,并测量转录本的丰度,以准确、全面的表达谱。

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大全基因组测序

对大型复杂基因组(人类、植物或动物)进行测序,提供了基因组改变的一个碱基视图,为疾病或种群基因组学的研究提供信息。

研究人员采访

将向日葵育种带入基因组学时代

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dna蛋白质相互作用分析

将染色质免疫沉淀(ChIP)分析与测序相结合,ChIP- seq是一种强大的全基因组基因调控调查方法。

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甲基化测序

通过基于测序的DNA甲基化分析实现高覆盖率密度和灵活性的表观遗传研究。

研究人员采访

神秘的转移

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编码转录组分析

利用RNA编码区域的序列特异性捕获来检测RNA外显子组的已知和新特征。

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德诺维测序

随着高输出,长读取和配对结束测序的独特混合,Hiseq是一个强大的工具新创没有参考基因组的物种测序。

研究人员采访

组装猕猴桃基因组

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宏基因组

通过对整个微生物群落进行宏基因组分析,以发现重要的分类和功能信息。

研究人员采访

研究密西西比河沿岸的微生物

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基因分型结果进行排序

通过测序进行基因分型提供了一种低成本的基因筛选方法,可以发现新的植物和动物snp并进行基因分型研究。

研究人员采访

用基因组学恢复和管理鱼类种群

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小全基因组测序

小基因组测序为公共卫生、流行病学和疾病研究提供了微生物或病毒基因组的全面分析。

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miRNA和小RNA分析

分离小RNA(如microRNA)并测序,研究非编码RNA在基因沉默和转录后调控中的作用。

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目标基因的面板

靶向基因测序面板含有定义的探针集,重点是感兴趣的特定基因。可以使用预测和定制面板。

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16 s rRNA测序

一种无培养方法,用于识别和比较来自复杂的微生物体或难以研究的环境的细菌。

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翻译分析

核糖体分析使系统监测细胞翻译过程和预测蛋白质丰度。

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靶向RNA表达分析

靶向RNA测序(RNA- seq)侧重于特定的转录本,用于分析基因表达和识别融合基因。

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扩增子测序

PCR扩增物的超深测序可以在一次检测中对多达数百个目标基因组区域进行经济有效的分析。

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Cytogenomics

新一代测序提供了一个碱基一个碱基,全基因组染色体变异检测,以补充阵列为基础的细胞基因组分析。

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人口研究

人口基因组学计划将大规模基因组和临床数据整合到学习卫生系统中,推动卫生保健创新。yobet亚洲

研究人员采访

见证了测序能力的巨大变化

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样品质量控制

在将测序库投入全规模运行之前,或在生物生产研究中进行质量控制应用之前,评估测序库的质量。

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Illumina方法指南

方法指南

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