HiSeq 2500系统的性能指标

Hiseq 2500提供了具有高输出和快速运行模式的高吞吐量测序应用的灵活解决方案

HiSeq 2500规格

设备规格
HiSeq SBS V4
读长度 1 × 36 bp 2 × 50 bp 2 × 100bp 2×125 bp
双流量细胞 128 - 144 Gb 360 - 400 Gb 720 - 800 Gb 900 Gb-1结核病
单流细胞 64-72 GB. 180 - 200 Gb 360 - 400 Gb 450 - 500 Gb
双流单元运行时间 29个小时 2.5天 5天 6天
Truseq SBS V3
读长度 1 × 36 bp 2 × 50 bp 2 × 100bp 2×125 bp
双流量细胞 95-105 GB. 270-300 GB. 540 - 600 Gb N/A
单流细胞 47-52 GB. 135 - 150 Gb 270-300 GB. N/A
双流单元运行时间 2天 5.5天 11天 N/A
额外的设备规范
HiSeq SBS V4
流动细胞类型 双流量细胞 单流细胞
读取传递过滤器(每个流单元8条通道) 高达40亿个单读或80亿个配对端读 高达20亿条单读或40亿条配对端读
质量
  • 在2 × 50 bp处Q30以上的碱基大于85%
  • Q30以上的碱基在2 × 100 bp处大于80%
  • 在2 × 125 bp处Q30以上碱基大于80%
Truseq SBS V3
流动细胞类型 双流量细胞 单流细胞
读取传递过滤器(每个流单元8条通道) 高达30亿个单读或60亿个配对端读 高达15亿条单读或30亿条配对端读
质量
  • 在2 × 50 bp处Q30以上的碱基大于85%
  • Q30以上的碱基在2 × 100 bp处大于80%

*基于Illumina Phix控制库的安装规范在支持的群集密度(610-678 K簇/ mm之间)2使用TruSeq v3套件或870 - 930k集群/mm的过滤器2使用HiSeq v4传递过滤器)。高输出模式的运行时间只对应于排序。性能可能因样本质量、聚类密度和其他实验因素而有所不同。

设备规格
HiSeq快速SBS Kit V2
读长度 1 × 36 bp 2 × 50 bp 2 × 100bp 2×150 bp 2×250 bp
双流量细胞 18-22 GB. 50-60 GB. 100 - 120 Gb 150 - 180 Gb 250 - 300 Gb
单流细胞 9-11 GB. 25-30 GB. 50-60 GB. 75-90 GB. 125-150 GB.
双流单元运行时间 7小时 16小时 27日人力资源 40小时 60小时
额外的设备规范
HiSeq快速SBS Kit V2
流动细胞类型 双流量细胞 单流细胞
读取传递过滤器(每个流单元2通道) 高达6亿次单读或12亿次成对端读 最多3亿单读或6亿配对读数
质量
  • 在2 × 50 bp处Q30以上的碱基大于85%
  • Q30以上的碱基在2 × 100 bp处大于80%
  • 在2 × 250 bp, Q30以上的碱基大于75%

†安装规格基于Illumina PhiX控制库支持的集群密度(在700-820 K集群/mm之间)2使用HiSeq Rapid v2 kit进行滤波)。快速运行模式的运行时间对应于车载集群生成(1.5小时)和排序。性能可能因样本质量、聚类密度和其他实验因素而有所不同。早期的HiSeq 2000仪器升级到HiSeq 2500时运行速度会稍慢一些。

MiSeq FGx系统规格表

HiSeq 2500系统规格表

生产规模测序的动力和效率。

查看规范表
合成测序(SBS)技术

HiSeq 2500系统利用经过验证的Illumina sbsttechnology,为广泛的应用提供高精度的数据和稳健的性能。SBS使用一种可逆终止方法,用荧光标记的核苷酸检测单个碱基,因为它们被纳入生长的DNA链中。

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Paired-End测序技术

对端测序使DNA片段的两端都能被测序。因为每一对读取数据之间的距离是已知的,所以对齐算法可以利用这些信息更精确地映射重复区域上的读取数据。这样就可以更好地比对reads,特别是在基因组中难以测序的重复区域。

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