理解双指数排序
与其他索引策略相比，独特的双索引允许您增加每次运行排序的样本数，并降低每个样本的成本。只需一个独特的双索引板，您就可以将96个样本汇集在一起。
双指标测序策略
除了唯一双索引外，双索引排序的另一种策略是使用组合双索引。在为多路复用准备库时，我们建议使用唯一的双索引。对于双索引库，排序运行包括两次额外的读取。额外的读取数据允许运行后分析软件以更高的准确性进行多路复用。
唯一对偶索引
为了防止井板中的重复序列，唯一双重索引使用样本两端的唯一标识符。
一个独特的双索引板可以使用96个唯一的索引1 (i7)适配器和96个唯一的索引2 (i5)适配器将96个样本合并在一起。
组合对偶指数
使用组合双索引，序列在井板的行和列之间重复。
索引被限制为8个唯一的双对的索引组合，因此索引适配器共享一些序列。大多数库在i7或i5端共享序列。
唯一对偶和组合对偶索引适配器的比较
一个独特的双索引板可将96个样本汇集在一起。相反，组合对偶索引仅限于索引8个唯一对偶对的组合。
推荐用于关键应用的索引适配器和库准备工具包
| 应用程序 | 图书馆准备工具包 | 推荐的索引解决方案 |
|---|---|---|
| 全基因组测序 | Illumina DNP制备 | IDT为Illumina UD指数 |
| RNA测序 | Illumina单链mRNA制备 Illumina链总RNA Prep |
IDT为Illumina - RNA |
| 扩增子测序 | 照明面板的AmpliSeq | Illumina的AmpliSeq UD索引（用于≤ （24个样本） Illumina的AmpliSeq UD指数（对于>24个样本） |
| 靶向DNA富集 | Illumina DNA富集制备 | Illumina Nextera UD索引IDT |
经常一起购买
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我应该使用唯一的双索引还是唯一的分子标识符？
唯一双索引在多路复用时可以有效地减少索引跳变引起的样本错配。当使用带有图形流池的仪器时，例如NovaSeq 6000系统，udi尤其有效。
独特的分子标识符已被证明可以降低假阳性变异调用率，并提高变异检测的灵敏度。它们可用于去除DNA和cDNA中的PCR重复，以及检测低频变异，如高度复合CNV检测。了解更多关于亚博官网人口yobet亚洲唯一的分子标识符。
单索引vs双索引
一般来说，双索引是首选的方法。双指数排序确实需要额外的周期；但是，试剂盒的供应量足以执行额外的循环。在以下情况下，您可能仍希望执行单个索引：
- 仪器不支持双测序(HiSeq 1000/1500系统)
- 读数需要再长几个碱基
- 您的日程安排不允许运行第二个索引所需的额外1-2小时
双索引排序资源
Illumina适配器序列
本文件包含几个Illumina库制备试剂盒中使用的Illumina适配器的寡核苷酸序列。
索引顺序指导
yobet亚洲了解Illumina仪器上的单索引和双索引测序。
Illumina适配器池指南
本文档提供了在汇集索引库时优化所有Illumina系统颜色平衡的建议。
Illumina公司适配器支持
查找用于Illumina唯一双索引的IDT的有用资源和支持信息。