空间转录组学提供了完整组织切片内转录活性的全面路线图。根据不同的方法,该方法可以使用杂交技术或高灵敏度的下一代测序(NGS)驱动的RNA测序(RNA- seq)技术检测转录活性。无论采用何种方法,空间转录组学都可以在结构保存的组织中准确地解析细胞水平上的mRNA表达。
yobet亚洲了解使用NanoString GeoMx数字空间分析器和Illumina NGS测序系统的复杂组织的高分辨率、高通量空间转录组学。
空间转录组学的一个关键好处是,它提供了映射到组织切片上的基因表达模式的地形排列,以连接结构和活性。这种能力使研究人员能够在细胞水平上阐明生物相互作用,以获得对复杂组织(如肿瘤微环境)的新见解。
使用这种方法,您将能够绘制正常组织和病变组织中的细胞活动,发现以前未知的相互作用,创建细胞活动的定量地图集等等。Illumina提供测序平台和软件分析工具,与合作解决方案集成,提供无缝的端到端空间转录组学解决方案,具有可靠性、可扩展性和敏感性。
为了在空间上解析组织切片中的mRNA表达,可以使用空间定位探针在载玻片上捕获冷冻切片或福尔马林固定的石蜡包埋组织的转录本,或者使用光活性原位杂交探针在特定感兴趣的区域直接检测。cDNA文库测序和分析定量表达水平。根据所选择的方法,1,200-21,000个蛋白质编码基因的表达可以在单个读数中进行定量分析,并准确绘制以提供组织切片的转录信息。
利用10x基因组公司的Visium空间基因表达对整个组织切片进行转录分析。
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空间生物学可以在细胞水平上结合其他分析方法,如表观基因组学、基因组学和蛋白质组学信息,同时类似地提供保存组织内的上下文信息。这些方法统称为空间多元组学,为全面理解生物系统提供了一个多维的方法。对于许多空间多组应用,Illumina提供了ngs支持的技术,可以连接结构、功能和空间洞察,以实现您的下一个发现。
切片并准备新鲜冷冻或福尔马林固定,石蜡包埋的组织到载玻片上。
图像和构造用于排序步骤的库。
请参阅Illumina的测序系统,以找到适合您的方法。
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